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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 大家做NBO分析都用其中的什么内容呢？总觉得自己分析不够透彻...
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亍寞

金虫 (小有名气)

[交流] 大家做NBO分析都用其中的什么内容呢？总觉得自己分析不够透彻...

每次分析NBO结果的时候都觉得利用其中的数据量太少了.......想做进一步的分析也不知道再去看些什么...
每次都是着眼于自然电荷，Wiberg键级，几个被研究键的占据数，键型，轨道能量啥的，弱作用看看二阶稳定化能，电子离域啥的
顺便有一个问题，如果是化合物，需要分析那个二阶稳定化能么？看过的NBO文章都没有用它来分析成键的...有人看见过相关文献么？

各位大牛们都在用NBO分析什么呢，请指教哈~~
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1楼 2011-06-22 08:22:07
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yangfan0818

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
亍寞(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-06-22 16:34:57
引用回帖:
Originally posted by 亍寞 at 2011-06-22 08:22:07:
每次分析NBO结果的时候都觉得利用其中的数据量太少了.......想做进一步的分析也不知道再去看些什么...
每次都是着眼于自然电荷，Wiberg键级，几个被研究键的占据数，键型，轨道能量啥的，弱作用看看二阶稳定化能 ...

一般我们用Wiberg键级分析键之间的相互作用大小，相互作用大的键级大，相互作用小的键级小，它代表了电子云重叠的程度。二阶稳定化能是相互作用后能量的降低，值越大作用越强，越有助于体系稳定。当两个化合物的稳定性已知，我们可以从轨道的稳定性，及二阶稳定化能来分析他们的相对稳定性。可以看看NBO的原始文献。Chem.Rev.1988,88,899-926
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12楼2011-06-22 15:53:19
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yongleli

木虫 (正式写手)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
19楼: Originally posted by 13512385488 at 2011-08-05 10:00:21:
请问一个问题，本来气相中，前一个中间体，能量是比过渡态低的，但是算出溶剂化效应后，过渡态反而比前一个中间体能量低了，昏死~~~~！！

显然到了溶液中反应路径就变了呗。。。。。。
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20楼2011-08-05 12:17:43
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普通回帖

冲刺哦

新虫 (正式写手)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
我都是用它来分析电荷的，你还想用NBO来做什么呢？
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2楼2011-06-22 09:31:45
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liang8887

至尊木虫 (文坛精英)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
学习一下！
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4楼2011-06-22 09:52:27
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boylc789

木虫 (著名写手)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
NBO使用总出错的人飘过
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5楼2011-06-22 12:12:17
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jincanyan

荣誉版主 (职业作家)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
不懂帮顶
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8楼2011-06-22 12:35:28
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lorna639

木虫 (著名写手)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by 亍寞 at 2011-06-22 08:22:07:
每次分析NBO结果的时候都觉得利用其中的数据量太少了.......想做进一步的分析也不知道再去看些什么...
每次都是着眼于自然电荷，Wiberg键级，几个被研究键的占据数，键型，轨道能量啥的，弱作用看看二阶稳定化能 ...

我刚开始接触NBO，是利用高斯自带的NBO，请问可以算出来Wiberg键级么？如何看输出文件的Wiberg键级？还有键型如何在输出文件中看出来？多谢了
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10楼2011-06-22 14:23:12
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亍寞

金虫 (小有名气)
★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-08-06 17:19:18
引用回帖:
Originally posted by lorna639 at 2011-06-22 14:23:12:
我刚开始接触NBO，是利用高斯自带的NBO，请问可以算出来Wiberg键级么？如何看输出文件的Wiberg键级？还有键型如何在输出文件中看出来？多谢了

最后一行加上：$NBO bndidx $END就行了
pop=(nboread,savemixed)
...
X                  0.00000000    0.00000000    0.00000000
X                  0.00000000    0.00000000    0.00000000
X                  0.00000000    0.00000000    0.00000000

$NBO bndidx $END

就这样
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11楼2011-06-22 15:38:13
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奔鲨

铁虫 (著名写手)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by yangfan0818 at 2011-06-22 15:53:19:
一般我们用Wiberg键级分析键之间的相互作用大小，相互作用大的键级大，相互作用小的键级小，它代表了电子云重叠的程度。二阶稳定化能是相互作用后能量的降低，值越大作用越强，越有助于体系稳定。当两个化合物 ...

学习啦
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13楼2011-06-22 16:02:02
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亍寞

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yangfan0818 at 2011-06-22 15:53:19:
一般我们用Wiberg键级分析键之间的相互作用大小，相互作用大的键级大，相互作用小的键级小，它代表了电子云重叠的程度。二阶稳定化能是相互作用后能量的降低，值越大作用越强，越有助于体系稳定。当两个化合物 ...

嗯，谢谢你诶~这些都还知道，那篇被引n千次的文献看过了已经，就是想看看有没有什么新一点的东西可以研究，总觉得仅仅凭借这些东西有些问题还是说不明白......

谢谢啦~
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14楼2011-06-22 17:27:06
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yangfan0818

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 亍寞 at 2011-06-22 17:27:06:
嗯，谢谢你诶~这些都还知道，那篇被引n千次的文献看过了已经，就是想看看有没有什么新一点的东西可以研究，总觉得仅仅凭借这些东西有些问题还是说不明白......

谢谢啦~

我也在想，可不可通过这些可以研究跟多的东西，应该还能找出更好的点
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15楼2011-06-22 17:44:58
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majun04

木虫 (著名写手)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by 亍寞 at 2011-06-22 08:22:07:
每次分析NBO结果的时候都觉得利用其中的数据量太少了.......想做进一步的分析也不知道再去看些什么...
每次都是着眼于自然电荷，Wiberg键级，几个被研究键的占据数，键型，轨道能量啥的，弱作用看看二阶稳定化能 ...

请问你用NBO做自然电荷分析的时候，输出数值能不能作为原子被亲核进攻或者亲电进攻容易程度的标准？
比如说，在甲醛中羰基碳原子的亲电能力要比丙酮中羰基碳原子的亲电能力高。这是因为甲基具有给电子能力，从而增强了羰基碳原子的电负性，降低了它的亲核性。
而在计算当中发现，单独优化了甲醛和丙酮的分子，对其进行NBO分析以后，得到的结果不是这样的。
请帮忙解答一下，是怎么回事，谢谢帮忙。
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16楼2011-06-29 20:29:54
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亍寞

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by majun04 at 2011-06-29 20:29:54:
请问你用NBO做自然电荷分析的时候，输出数值能不能作为原子被亲核进攻或者亲电进攻容易程度的标准？
比如说，在甲醛中羰基碳原子的亲电能力要比丙酮中羰基碳原子的亲电能力高。这是因为甲基具有给电子能力，从 ...

因为不是做有机的，这一片不是太了解，不知道具体要怎么应用，但是你计算NBO电荷的时候方法基组怎么选择，对计算结果影响还是蛮大的，之前想用NBO里面轨道的能量初步比较一下原子轨道能量，泛函给出的就跟从头算给出的不一样...而且不知道你是怎么比较的，是单个原子的电荷还是原子团呢
要不你看看这两个帖子，看看有没有启发好了，本人才疏学浅，抱歉呢...

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3205116   （这个的话，如果用非HF方法，加上density=current）

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2456809
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17楼2011-06-29 22:11:25
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雪灵

新虫 (初入文坛)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
不是可以分析轨道吗？
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18楼2011-07-09 10:40:31
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13512385488

新虫 (小有名气)
★
亍寞(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
11楼: Originally posted by 亍寞 at 2011-06-22 15:38:13:
最后一行加上：$NBO bndidx $END就行了
pop=(nboread,savemixed)
...
X                  0.00000000    0.00000000    0.00000000
X                  0.00000000    0.00000000    0.00000000
X       ...

请问一个问题，本来气相中，前一个中间体，能量是比过渡态低的，但是算出溶剂化效应后，过渡态反而比前一个中间体能量低了，昏死~~~~！！
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19楼2011-08-05 10:00:21
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2076014楼: Originally posted by 雪灵 at 2011-07-09 10:40:31
不是可以分析轨道吗？

你好，请问如何通过它来分析轨道的？
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21楼2012-10-19 10:15:53
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marson

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
同求NBO的详细介绍
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22楼2013-03-27 14:32:36
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简单回复
leimiao_hit3楼
2011-06-22 09:38   回复  
亍寞(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by 亍寞 at 2011-06-22 08:22:07: 每次分析NBO结果的时候都觉得利用其中的数据量太少了.......想做进一步的分析也不知道再去看些什么... 每次都是着眼于自然电荷，Wiberg键级，几个被研究键的占据数，键型，轨道能量啥的，弱作用看看二阶稳定化能 ...

祝福
tangbohejin6楼
2011-06-22 12:29   回复  
亍寞(金币+1):谢谢参与
ly20112011a7楼
2011-06-22 12:33   回复  
亍寞(金币+1):谢谢参与
zyxme9楼
2011-06-22 12:38   回复  
亍寞(金币+1):谢谢参与
祝福
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