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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求MS中DPD程序的源代码
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ghy8879

银虫 (小有名气)

[求助] 求MS中DPD程序的源代码

刚接触DPD，理论上有了初步的了解，但想知道程序是如何实现的，一些概念还是很模糊，希望能通过源代码的方式对其有更清楚地理解！
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1楼 2011-06-21 12:23:02
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

rzhheart

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by yahoohoo at 2011-06-22 13:41:12:
我自己写点程序。

能自己写程序，大牛中的大牛啊~
小菜鸟路过！
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勤奋，求实，进取，奉献！
9楼2011-06-22 20:53:07
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普通回帖

xjw040

金虫 (正式写手)
★
御剑江湖(金币+1): 加油 2011-06-22 18:49:28
我也是才接触DPD的，我主要还MS中DPD模块，一般情况还是可以的。

lammps里面的源文件看不懂。

咱们一块研究研究
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2楼2011-06-21 19:37:59
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ghy8879

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xjw040 at 2011-06-21 19:37:59:
我也是才接触DPD的，我主要还MS中DPD模块，一般情况还是可以的。

lammps里面的源文件看不懂。

咱们一块研究研究

我目前用的也是MS中的DPD，但其中一些参数的设置我迷迷糊糊的，看文献中也没有相关设置的具体介绍，读里面的help菜单，也容易晕，呵呵，所以想通过源代码来看看 其是怎么实现从理论到具体算法的。请问，DPD中多个水分子处理成一个珠子是怎么实现的啊？还有里面的相互作用参数可以随便设啊？
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3楼2011-06-21 20:55:36
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

ghy8879(金币+2): 谢谢 2011-06-22 11:10:32
引用回帖:
Originally posted by ghy8879 at 2011-06-21 12:23:02:
刚接触DPD，理论上有了初步的了解，但想知道程序是如何实现的，一些概念还是很模糊，希望能通过源代码的方式对其有更清楚地理解！

商业软件不可能给你源代码的
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4楼2011-06-22 03:59:31
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xjw040

金虫 (正式写手)
你是模拟什么体系的？
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5楼2011-06-22 09:02:31
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ghy8879

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xjw040 at 2011-06-22 09:02:31:
你是模拟什么体系的？

目前处于DPD熟悉阶段，是高分子溶液，需要定义水珠子啊，呵呵，DPD中要求珠子的质量和大小要相差不大，一个水分子太小了，文献中也有说多个水分子作为一个珠子，但具体怎么操作呢？
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6楼2011-06-22 10:45:36
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ghy8879

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yahoohoo at 2011-06-22 03:59:31:
商业软件不可能给你源代码的

也是，呵呵，想着虫友很厉害，就试试看了；看Lammps DPD源代码也行，反正方法都一样；你用什么模拟软件啊，膜生物物理是做啥的啊？
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7楼2011-06-22 10:53:18
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ghy8879 at 2011-06-22 10:53:18:
也是，呵呵，想着虫友很厉害，就试试看了；看Lammps DPD源代码也行，反正方法都一样；你用什么模拟软件啊，膜生物物理是做啥的啊？

我自己写点程序。
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8楼2011-06-22 13:41:12
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ghy8879

银虫 (小有名气)
做模拟的 想深入 就应写点儿程序啊；小硕就先用别人的打打基础类
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10楼2011-06-23 08:35:19
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