应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】DPD程序编写边界如何处理？
131/2返回列表12下一页
查看: 1669  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

liufei5828

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】DPD程序编写边界如何处理？ 已有8人参与

请教：自己编写DPD程序的时候，如何将粒子限定在一个长方体盒子里面呢？因为粒子受的是排斥力，如果不加以限制，粒子都跑到盒子外面去了…… 谢谢~~

[ Last edited by ghcacj on 2011-3-23 at 11:50 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-03-23 11:19:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)
★
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-01 21:05:24
PBC
2楼2011-03-23 18:36:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Jianyi_Liu

捐助贵宾 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-24 13:02:11
看你做的什么尺度，形状材料，一般基本的用周期边界PBC来限制。PBC表象是将粒子限制在一个盒子内，它的本质是能够用来比较真实的模拟块体的情形，忽略表面效应。如果是边界效应较强，可以加真空层。
赞一下(2人) 回复此楼
吾善养吾浩然之气
3楼2011-03-23 19:44:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufei5828

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by liufei5828 at 2011-03-23 11:19:32:
请教：自己编写DPD程序的时候，如何将粒子限定在一个长方体盒子里面呢？因为粒子受的是排斥力，如果不加以限制，粒子都跑到盒子外面去了…… 谢谢~~

[ Last edited by ghcacj on 2011-3-23 at 11:50 ]

4楼2011-03-25 14:41:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufei5828

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by tianlangxingaa at 2011-03-23 18:36:41:
PBC

谢谢，请问一般都是用的什么语言编写的程序呢，我用的matlab，速度超级慢，而且粒子稍微多一点，就提示内存不足……
赞一下 回复此楼
5楼2011-03-25 14:44:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-03-28 12:12:53
it's better for you to choose fortran or C.

Matlab is not a good choice.
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2011-03-27 18:20:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+5): 谢谢 2011-03-29 12:41:49
引用回帖:
Originally posted by liufei5828 at 2011-03-25 14:44:10:
谢谢，请问一般都是用的什么语言编写的程序呢，我用的matlab，速度超级慢，而且粒子稍微多一点，就提示内存不足……

对于简单的数值模拟，比如MD，严格来说fortran是最快的语言。尤其是对于数组的处理，可以读取或者存储任意数组的数值，有人做过测试，Fortran是C的1.2倍。

但是如果数组量过大，则C是个不错的选择.

如果数值模拟里面全涉及到矩阵的转换等等，Matlab是最好的选择，本身所带的矩阵处理功能非常方便，但是如果单纯是类似MD或者DPD的简单数值计算，不推荐这个，很慢，很慢。

希望对你有用。
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2011-03-28 22:51:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufei5828

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by tianlangxingaa at 2011-03-28 22:51:16:
对于简单的数值模拟，比如MD，严格来说fortran是最快的语言。尤其是对于数组的处理，可以读取或者存储任意数组的数值，有人做过测试，Fortran是C的1.2倍。

但是如果数组量过大，则C是个不错的选择.

如果数 ...

谢谢，谢谢~~~ 考虑选择C了~~~
赞一下 回复此楼
8楼2011-03-30 08:04:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guanzhouxmc

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-04-01 12:25:12
LAMMPS对于连续性问题有很好的兼容性，我用它做的DPD结果从来都是超出边界的，不影响模拟结果。既然LZ喜欢C的话也可以尝试下，有什么好想法交流一下啊。
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2011-03-31 08:50:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zkh329

至尊木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-04-01 12:25:22
用FORTRAN,我们课题组用的就是FORTRAN
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2011-03-31 16:25:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liufei5828 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料化工总分334求调剂 +14 Riot2025 2026-04-08 14/700 2026-04-09 17:36 by yongzhesheng
[考研] 电子信息270求调剂 +10 terminal469 2026-04-07 10/500 2026-04-09 17:29 by wp06
[考研] 283求调剂，工科！ +4 苏打水7777 2026-04-08 4/200 2026-04-09 17:28 by vgtyfty
[考研] 调剂 +7 只叙离别辞 2026-04-09 9/450 2026-04-09 16:58 by 1753564080
[考研] 材料295 +15 小英11 2026-04-03 16/800 2026-04-09 15:44 by only周
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +5 白云123456789 2026-04-09 6/300 2026-04-09 14:04 by 白云123456789
[考研] 283电子信息求调剂 +4 三石WL 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:21 by wp06
[考研] 270求调剂 +3 031127 2026-04-06 4/200 2026-04-08 21:00 by 逆水乘风
[考研] 调剂 +3 电气300求调剂不 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:39 by 电气300求调剂不
[考研] 362求调剂 +8 我要考大 2026-04-06 12/600 2026-04-08 00:32 by JourneyLucky
[考研] 一志愿郑州大学材料与化工085600，求调剂 +34 吃的不少 2026-04-02 34/1700 2026-04-07 20:01 by lrll?l
[考研] 22408 318分求调剂 +4 勤奋的小笼包 2026-04-06 6/300 2026-04-07 15:05 by 纸鹤555
[考研] 材料工程302分求调剂 +13 zyx上岸！ 2026-04-04 13/650 2026-04-07 11:14 by 诗与自由
[考研] 344材料与化工调剂 +9 调剂上岸玘 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:10 by happyddm
[考研] 能动调剂326专硕 +4 wan112233 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:47 by yu221
[考研] 334求调剂 +8 曾仰之 2026-04-03 8/400 2026-04-04 11:16 by w_xuqing
[考研] 268求调剂 +8 你好tg 2026-04-03 9/450 2026-04-04 05:08 by gswylq
[考研] 338求调剂 +4 zzz，，r 2026-04-03 4/200 2026-04-03 16:39 by lijunpoly
[考研] 初试成绩337找调剂 +3 ??? ?. ? 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:43 by 土木硕士招生
[考研] 生物学硕341求调剂 +4 你笑起来像云朵 2026-04-03 4/200 2026-04-03 10:32 by macy2011
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭