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夏尔list

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
silicare(金币+5, EPI+1): 对照不可少 2011-07-07 17:30:26
之前我也有一个没有扩出来,那个很变态的。开始区GC含量很高,几乎就没什么AT。两个月没弄出来跟老师说了就换其他的了,别的扩了一次就扩出来了。其实说实话,扩不出来就是扩不出来,一般引物温度什么的问题都不是很大,RNA质量啊当然有关系,不过现在试剂盒什么的都应该很好用了,你问师兄师姐要点cDNA不同的扩一下,Actin也扩一下,再扩不出来就不是你的问题了。扩不出来很正常的。
11楼2011-06-24 14:28:45
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lidongqiao

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by rb at 2011-06-23 23:16:15:
反转录试剂盒是哪家的?千万不要是takara,takara定量pcr的是短片段的。很多没有详细说明的反转录试剂盒供定量PCR使用的是很难得到全长产物的。我4年前吃过这个亏的。

我用的是invitrogen的反转录试剂盒,我把800BP的条带去测序了,发现不是我的全长,不知道问题出在哪里了
12楼2011-07-06 16:23:18
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rb

木虫 (著名写手)

小笨虫虫

【答案】应助回帖


silicare(金币+1): 谢谢参与 2011-07-07 17:30:45
引用回帖:
Originally posted by lidongqiao at 2011-07-06 16:23:18:
我用的是invitrogen的反转录试剂盒,我把800BP的条带去测序了,发现不是我的全长,不知道问题出在哪里了

你可以用一下特定引物的rt(针对你的基因设计反转录引物),然后用高保真酶在做PCR,我当年喜欢用 Advantage® 2 DNA Polymerase Mix ,效果很理想。你可以试试。
寝室楼的大爷、大妈都是哲学家,他们每天都在思考人类最根本的三个问题:你是谁?你从哪儿来?要去哪儿?
13楼2011-07-06 16:42:21
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mengmenglu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
silicare(金币+2): 可行 2011-07-07 17:31:05
这个,你才三个月,所以继续吧,我是扩了快一年才出来!你试一下梯度,找出最适的温度吧!
14楼2011-07-07 15:44:27
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feirlu

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天(金币+4): 新人鼓励 常来 2011-09-08 17:04:46
看天(金币+4): 新人鼓励 常来 2011-09-08 17:05:07
看天(金币+4): 新人鼓励 常来 2011-09-08 17:05:26
引用回帖:
14楼: Originally posted by mengmenglu at 2011-07-07 15:44:27:
这个,你才三个月,所以继续吧,我是扩了快一年才出来!你试一下梯度,找出最适的温度吧!

不是吧?一年?我跟楼主有同样情况,cox亚基1一扩就扩出来了,亚基2跟亚基3到现在都很离谱,扩出来2次,但再在扩出来的温度条件下扩,就什么都没有,touchdown pcr也试过了,没个反应的都,扩出来过肯定不是引物问题,模板已经用其它引物确定没问题,请教下该如何改进呢?
15楼2011-09-08 16:51:16
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feirlu

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

看天: 这个不算应助 2011-09-08 17:07:18
楼主现在扩增的怎么了?我的情况也类似啊。。。
16楼2011-09-08 16:52:25
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临风7071

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


lstt09nk(金币+1): 鼓励交流 2011-09-17 13:17:09
楼主,你看看是不是你的GC含量很高的啊?
实在不行,你就分段扩,在连起来
17楼2011-09-17 10:27:54
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320080920001

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
lstt09nk(金币+2): 鼓励交流 2011-09-17 13:16:08
高GC含量的PCR可以加入一些甜菜碱或者甘油,不知道楼主的Marker使用的是哪的,貌似今天刚听师兄说天根的marker不准。还有,上样孔有亮点我觉得除了样品不纯没有其他解释吧,如果你减少胶浓度,还有亮点的话,我觉得只能说明是有蛋白污染了。
18楼2011-09-17 11:40:55
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spiderboy

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你可以尝试把全长分两段扩,然后再把两段连起来,这样比较容易,而且碱基变异的概率低。
19楼2011-09-17 13:33:19
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320080920001

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

19楼说的很对啊,我之前去过的实验室用LIC系统,可以最多把7段片段连起来,效率很高啊。
20楼2011-09-18 10:30:50
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