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179510317

木虫 (著名写手)

[交流] 结构精修遇到的问题 已有2人参与

加氢后，refine出现BAD FAIXCONNECTIVITY:C28 BONDS TO N10 C27，不能修，这是什么意思啊，为什么会出现这个提示，
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1楼 2011-06-10 16:43:12
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peterdong

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
drg1984(金币+1): 谢谢回帖交流！ 2011-06-10 21:05:37
c28 to n10 c27的氢加错了，可以删掉重新加或者将氢原子的方向改为自由方向
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2楼2011-06-10 17:45:08
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by 179510317 at 2011-06-10 16:43:12:
加氢后，refine出现BAD FAIXCONNECTIVITY:C28 BONDS TO N10 C27，不能修，这是什么意思啊，为什么会出现这个提示，

可能数据不够好或有统计， 导致不该连的原子连到一起去了，结果原来加的H就不对了。

解决办法， 删掉C28的氢，做些固定， 使得分子的几何构型合理。 然后再加氢。
是py?
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xi2004-emuch@163.com
3楼2011-06-11 15:01:31
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