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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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179510317

管理员

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[交流] 结构精修遇到的问题 已有2人参与

加氢后,refine出现BAD FAIXCONNECTIVITY:C28 BONDS TO N10 C27,不能修,这是什么意思啊,为什么会出现这个提示,
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peterdong

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drg1984(金币+1): 谢谢回帖交流! 2011-06-10 21:05:37
c28 to n10 c27的氢加错了,可以删掉重新加或者将氢原子的方向改为自由方向
2楼2011-06-10 17:45:08
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xi2004

超级版主

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引用回帖:
Originally posted by 179510317 at 2011-06-10 16:43:12:
加氢后,refine出现BAD FAIXCONNECTIVITY:C28 BONDS TO N10 C27,不能修,这是什么意思啊,为什么会出现这个提示,

可能数据不够好或有统计, 导致不该连的原子连到一起去了,结果原来加的H就不对了。

解决办法, 删掉C28的氢,做些固定, 使得分子的几何构型合理。 然后再加氢。
是py?
xi2004-emuch@163.com
3楼2011-06-11 15:01:31
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