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feiye2214木虫 (正式写手)
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[求助]
求actin上游的那个邻居
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 有人知道actin基因上游的那个基因是那个基因么？那么多的物种的全序列都出来了，actin这么保守的基因的上游邻居会不会也很保守，基因也应该不会有变化吧，每个物种的actin的上游基因应该都是某个特定基因吧因为在克隆actin的调控序列，walking进展缓慢啊 想从上游保守序列里设计引物，克隆调控序列 这样的想法不知道是否合理？给点指示哈，大家 |
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yabxxh
木虫 (正式写手)
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2楼2011-06-08 15:25:39
cdl007
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【答案】应助回帖
feiye2214(金币+8): 多谢，我试试，有问题能再问吧，呵呵 2011-06-10 14:03:11
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actin 基因有很多位点和假基因，看下图 如果是beta actin 参见在基因组里的分布 betaactin（actb）上下游的基因是FBXL18，FSCN1，功能与注释如下。 关于FBXL18，FSCN1的不同物种的同源性，你先自己做吧。如果实在不行的话再帮你分析。 推测一下啊可能保守性不是很好 UniProtKB/Swiss-Prot: FSCN1_HUMAN, Q16658 Function: Organizes filamentous actin into bundles with a minimum of 4.1:1 actin/fascin ratio. Probably involved in the assembly of actin filament bundles present in microspikes, membrane ruffles, and stress fibers Entrez Gene summary for FBXL18: Members of the F-box protein family, such as FBXL18, are characterized by an approximately 40-amino acid F-box motif. SCF complexes, formed by SKP1 (MIM 601434), cullin (see CUL1; MIM 603134), and F-box proteins, act as protein-ubiquitin ligases. F-box proteins interact with SKP1 through the F box, and they interact with ubiquitination targets through other protein interaction domains (Jin et al., 2004 (PubMed 15520277)).(supplied by OMIM)    |
3楼2011-06-08 20:55:45