24小时热门版块排行榜    

查看: 971  |  回复: 4

avhg

木虫 (著名写手)

幻象

[求助] BLAST的一个菜鸟级问题

psi-blast用了3次迭代,其中很多序列“No Hits Found!”
如果想要得到PSSM,是不是要提高迭代次数或者扩大搜索库?我现在用的是nr数据库。。。搜的是一种毒素蛋白。。。
欢迎用过psi-blast的前辈交流哈
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

只要坚持,胜利是迟早的事。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

springimu

木虫 (著名写手)

那就证明你的NR库有问题,或者程序问题
你先网上用blast试试
因为陌生,所以勇敢;因为距离,所以美丽
2楼2011-06-08 09:15:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

avhg

木虫 (著名写手)

幻象

引用回帖:
Originally posted by springimu at 2011-06-08 09:15:26:
那就证明你的NR库有问题,或者程序问题
你先网上用blast试试

应该不是nr库的问题吧。。。 貌似会有找不到序列的时候吧。。 网上也找不到。。。
只要坚持,胜利是迟早的事。
3楼2011-06-08 14:43:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyn0452

木虫 (正式写手)


设置阈值
4楼2011-06-14 10:45:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

avhg

木虫 (著名写手)

幻象

引用回帖:
Originally posted by yyn0452 at 2011-06-14 10:45:18:
设置阈值

嗯啊 设置E值和迭代次数
只要坚持,胜利是迟早的事。
5楼2011-06-14 11:14:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 avhg 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 06:46 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 06:11 by ZPa0EcMwuECS
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 05:51 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 03:26 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 02:40 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 3/150 2026-08-30 02:33 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:58 by ZPa0EcMwuECS
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:47 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 01:36 by ZPa0EcMwuECS
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 01:14 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 国社科申报系统有变化 +3 kynobel 2026-08-23 3/150 2026-08-29 21:57 by 余韵清
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +5 gdd2018 2026-08-28 10/500 2026-08-29 14:10 by Jacob678
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见