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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Semi-empirical » 计算结合能纠结了，让我迷惑啊！
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qianyang

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 计算结合能纠结了，让我迷惑啊！

本人研究超分子化学的，最近用软件计算超分子化学体系的结合能。结果数值差异之大，不知道让我相信谁的！
1 课题组已培养出了单晶，我把单晶的结构数据导入到Gaussian里，体系太大，就用了PM3凑合着算一下，opt后，计算单电能，单体1：-0.286HF；单体二：-0.354HF，混合后的：-0.296，结合能居然是正的!
2 再用了Hyperchem，PM3，opt，计算SP，单体1：-10544.3KJ/mol；单体二：-4109.21KJ/mol；混合后：-14696.13KJ/mol；结合能是：-42.6KJ/mol。貌似还比较准确的。
3 又用了MS软件，Compass力场计算，结果悲剧了，混合体total energy：1954Kcal/mol。居然是正的.......！
三种方法的计算结果差别也太大了吧！所以迷惑了，不知道什么办了，是不是这个当中有什么重要的步骤我没注意啊！请高手赐教啊。
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1楼 2011-06-03 09:26:26
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wenxianliu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
qianyang(金币+5): 2011-06-03 09:38:11
gmy1990(金币+2): 2011-06-03 11:01:48
你不能简单的比较单点能。准确的说应该比较：总能量+矫正过的零点能。
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2楼2011-06-03 09:29:44
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qianyang

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wenxianliu at 2011-06-03 09:29:44:
你不能简单的比较单点能。准确的说应该比较：总能量+矫正过的零点能。

谢谢。。！也就是说需要计算Freq，然后再把ZPE能量提取出来咯，具体是怎么个操作法啊！还请高手赐教啊！
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3楼2011-06-03 09:39:48
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 2011-06-03 11:01:33
既然体系很大 又是周期性体系 干嘛用高斯呢？vasp泪奔了
这种类型的计算 vasp更合适 见网址http://muchong.com/bbs/forumdisplay.php?fid=291&type=634
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4楼2011-06-03 10:12:45
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qianyang

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2011-06-03 10:12:45:
既然体系很大 又是周期性体系 干嘛用高斯呢？vasp泪奔了
这种类型的计算 vasp更合适 见网址http://muchong.com/bbs/forumdisplay.php?fid=291&type=634

版主！坛子里的VASP下不了啊，不知你是不是有啊！还望给个什么可以下载的连接啊，或者直接给个我啊，邮箱：qianyangrun@163.com
奇怪啊，我怎么加不了你金币啊，版主！
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5楼2011-06-03 10:30:37
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wenxianliu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

qianyang(金币+15): 基本上知道怎么回事了！谢谢。 2011-06-07 14:29:01
引用回帖:
Originally posted by qianyang at 2011-06-03 09:39:48:
谢谢。。！也就是说需要计算Freq，然后再把ZPE能量提取出来咯，具体是怎么个操作法啊！还请高手赐教啊！

是的，需要计算频率。零点能需要矫正，校正因子查高斯说明书或文献。然后总能量加上矫正后的零点能。
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6楼2011-06-07 10:53:03
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