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qianyang

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 计算结合能纠结了,让我迷惑啊!

本人研究超分子化学的,最近用软件计算超分子化学体系的结合能。结果数值差异之大,不知道让我相信谁的!
1 课题组已培养出了单晶,我把单晶的结构数据导入到Gaussian里,体系太大,就用了PM3凑合着算一下,opt后,计算单电能,单体1:-0.286HF;单体二:-0.354HF,混合后的:-0.296,结合能居然是正的!
2 再用了Hyperchem,PM3,opt,计算SP,单体1:-10544.3KJ/mol;单体二:-4109.21KJ/mol;混合后:-14696.13KJ/mol;结合能是:-42.6KJ/mol。貌似还比较准确的。
3 又用了MS软件,Compass力场计算,结果悲剧了,混合体total energy:1954Kcal/mol。居然是正的.......!
三种方法的计算结果差别也太大了吧!所以迷惑了,不知道什么办了,是不是这个当中有什么重要的步骤我没注意啊!请高手赐教啊。
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wenxianliu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
qianyang(金币+5): 2011-06-03 09:38:11
gmy1990(金币+2): 2011-06-03 11:01:48
你不能简单的比较单点能。准确的说应该比较:总能量+矫正过的零点能。
2楼2011-06-03 09:29:44
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qianyang

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by wenxianliu at 2011-06-03 09:29:44:
你不能简单的比较单点能。准确的说应该比较:总能量+矫正过的零点能。

谢谢。。!也就是说需要计算Freq,然后再把ZPE能量提取出来咯,具体是怎么个操作法啊!还请高手赐教啊!
3楼2011-06-03 09:39:48
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 2011-06-03 11:01:33
既然体系很大 又是周期性体系 干嘛用高斯呢?vasp泪奔了
这种类型的计算 vasp更合适 见网址http://muchong.com/bbs/forumdisplay.php?fid=291&type=634
4楼2011-06-03 10:12:45
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qianyang

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2011-06-03 10:12:45:
既然体系很大 又是周期性体系 干嘛用高斯呢?vasp泪奔了
这种类型的计算 vasp更合适 见网址http://muchong.com/bbs/forumdisplay.php?fid=291&type=634

版主!坛子里的VASP下不了啊,不知你是不是有啊!还望给个什么可以下载的连接啊,或者直接给个我啊,邮箱:qianyangrun@163.com
奇怪啊,我怎么加不了你金币啊,版主!
5楼2011-06-03 10:30:37
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wenxianliu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

qianyang(金币+15): 基本上知道怎么回事了!谢谢。 2011-06-07 14:29:01
引用回帖:
Originally posted by qianyang at 2011-06-03 09:39:48:
谢谢。。!也就是说需要计算Freq,然后再把ZPE能量提取出来咯,具体是怎么个操作法啊!还请高手赐教啊!

是的,需要计算频率。零点能需要矫正,校正因子查高斯说明书或文献。然后总能量加上矫正后的零点能。
6楼2011-06-07 10:53:03
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