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xcyqyz5233

金虫 (小有名气)

[求助] 有两个问题很困惑！

1.保存基态优化后的坐标可以在out文件中找到，有两种方法：
（1）用gview打开out文件，然后保存gjf文件，就可以得到分子坐标啦
（2）out文件中在优化完成最后有 Standard orientation:部分即是，不过你得把其中的部分数据删掉。这个可以在word中完成。  
   但是本人发现两种方式所得到的坐标是不一样的，两种方法都对吗？还是有什么区别？

2.优化激发态的方法有两种：

（1）优化激发态：以H2O为例
先用hf/6-31g 方法计算（h2O-hf.gjf），得到的构型再用cis(nstates=1,direct,singlet)/6-31g计算(h20-cisopt.gjf)，其结果用于下一步的光谱计算。
（2）直接可以用基态优化后的结构作为激发态的分子说明，然后用
hf/6-31g  cis(singlets,nstates=5) 来计算，其结果用于下一步的光谱计算。

这两种方法都对吗？？有什么区别吗？

谢谢各位咯！呵呵
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1楼 2011-05-27 11:31:49
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yongma2008

木虫 (著名写手)

论文？苦！主。

【答案】应助回帖

xcyqyz5233(金币+10): 谢谢您的指点和回复！哈哈，明白了 2011-05-27 19:35:05
第一个问题，原子坐标会因为坐标原点的位置和坐标轴的取向不同而不同，所以不用纠结于得到的两种坐标的xyz值是不是完全一样，关键问题是原子的相对位置，如果两种坐标下的原子相对位置一样，那就是一样的。
第二个没算过，楼下的来说一下。
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2楼2011-05-27 17:49:22
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