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请教柔性扫描和刚性扫描的适用性
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vigaryang
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请教柔性扫描和刚性扫描的适用性
打算优化一个分子的结构,获得其全局能量最小构型。该分子中含有一个正丁基支链,因此考虑对丁基的二面角进行扫描。请问对于这种情况,是该采用opt关键字进行柔性扫描呢,还是采用scan关键字进行刚性扫描再结合后续的优化?谢谢。
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1楼
2011-05-21 21:11:59
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【答案】应助回帖
vigaryang(金币+2): 2011-05-25 11:16:22
感觉,柔性对分子不大的体系,更好些。我感觉文献上,可能用的是柔性。但也要看文章介绍算法时,是怎么说的。
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君当如兰,幽谷长风,宁静志远
6楼
2011-05-25 09:55:01
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suosuosky
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【答案】应助回帖
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vigaryang(金币+5): 2011-05-24 14:12:50
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-25 09:40:23
我觉得最好使用柔性扫描比较好,反正你的分子也不大
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2011-05-24 10:12:15
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vigaryang
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引用回帖:
Originally posted by
suosuosky
at 2011-05-24 10:12:15:
我觉得最好使用柔性扫描比较好,反正你的分子也不大
谢谢。看到过一篇类似的文献,在该文献中有一张图片,其横坐标为某二面角(数据点间隔为10°),纵坐标为能量。这是否说明该文献是采用的刚性扫描?
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3楼
2011-05-24 14:12:30
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suosuosky
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vigaryang(金币+3): 2011-05-25 09:28:26
引用回帖:
Originally posted by
vigaryang
at 2011-05-24 14:12:30:
谢谢。看到过一篇类似的文献,在该文献中有一张图片,其横坐标为某二面角(数据点间隔为10°),纵坐标为能量。这是否说明该文献是采用的刚性扫描?
不一定吧,柔性扫描的结果也是这样的啊
可以仔细看看文献中是怎么说的^_^
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follow_my_dream
4楼
2011-05-24 15:45:38
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