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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请教柔性扫描和刚性扫描的适用性
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vigaryang

木虫 (正式写手)

[求助] 请教柔性扫描和刚性扫描的适用性

打算优化一个分子的结构，获得其全局能量最小构型。该分子中含有一个正丁基支链，因此考虑对丁基的二面角进行扫描。请问对于这种情况，是该采用opt关键字进行柔性扫描呢，还是采用scan关键字进行刚性扫描再结合后续的优化？谢谢。
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1楼 2011-05-21 21:11:59
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suosuosky

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
vigaryang(金币+5): 2011-05-24 14:12:50
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-25 09:40:23
我觉得最好使用柔性扫描比较好，反正你的分子也不大
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follow_my_dream
2楼2011-05-24 10:12:15
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vigaryang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by suosuosky at 2011-05-24 10:12:15:
我觉得最好使用柔性扫描比较好，反正你的分子也不大

谢谢。看到过一篇类似的文献，在该文献中有一张图片，其横坐标为某二面角（数据点间隔为10°），纵坐标为能量。这是否说明该文献是采用的刚性扫描？
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3楼2011-05-24 14:12:30
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suosuosky

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

vigaryang(金币+3): 2011-05-25 09:28:26
引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2011-05-24 14:12:30:
谢谢。看到过一篇类似的文献，在该文献中有一张图片，其横坐标为某二面角（数据点间隔为10°），纵坐标为能量。这是否说明该文献是采用的刚性扫描？

不一定吧，柔性扫描的结果也是这样的啊

可以仔细看看文献中是怎么说的^_^
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follow_my_dream
4楼2011-05-24 15:45:38
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vigaryang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by suosuosky at 2011-05-24 15:45:38:
不一定吧，柔性扫描的结果也是这样的啊

可以仔细看看文献中是怎么说的^_^

很多文献都只说研究了potential energy surface 或potential energy profile, 没提究竟是relax 还是 rigid。
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5楼2011-05-25 09:29:56
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王中学

木虫 (正式写手)

海边拾贝的顽童

【答案】应助回帖

vigaryang(金币+2): 2011-05-25 11:16:22
感觉，柔性对分子不大的体系，更好些。我感觉文献上，可能用的是柔性。但也要看文章介绍算法时，是怎么说的。
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君当如兰，幽谷长风，宁静志远
6楼2011-05-25 09:55:01
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vigaryang

木虫 (正式写手)
如果是进行柔性扫描的话，opt=z-matrix 和 opt=modredundant 是不是都可以实现，其区别只在于输入文件的写法不同？
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7楼2011-05-25 11:19:16
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