24小时热门版块排行榜    

查看: 1085  |  回复: 3

20071130055

新虫 (初入文坛)

[求助] g_gyrate中参数的意义

g_gyrate中参数的意义,我们计算中得出的
Energy                      Average   Err.Est.       RMSD  Tot-Drift
-------------------------------------------------------------------------------
Potential                  -36331.7        290    1329.64   -2056.31
其中的RMSD ,  Tot-Drift分别代表什么?
谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gxsulong

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


20071130055(金币+1): 2011-05-20 16:17:38
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-05-21 17:15:27
你这个应该是算势能g_energy出来的结果吧,我算的g_gyrate没有这个东西啊。
霉菌
2楼2011-05-20 08:25:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

20071130055

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by gxsulong at 2011-05-20 08:25:14:
你这个应该是算势能g_energy出来的结果吧,我算的g_gyrate没有这个东西啊。

是的,我是g_enery计算出现的,我弄错了,不好意思。谢谢
  但我还是要问RMSD ,  Tot-Drift分别代表什么?
3楼2011-05-20 16:24:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gxsulong

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
20071130055(金币+3): 2011-05-21 11:59:30
ghcacj(金币+5): 谢谢 2011-05-21 17:15:34
20071130055(金币+2): 2011-05-28 10:43:29
RMSD-均方根偏差,表示以t1时刻的蛋白质结构为参比所得t2时刻蛋白质结构的相对位置偏移,用于衡量蛋白质的整体结构随时间的变化;固定t=0,即以蛋白质天然结构为参比,因而Rmsd越大,表明此时蛋白质结构与天然结构的偏差越大,即其变性程度越大。另外一个我忘了,你查查手册吧。
霉菌
4楼2011-05-20 16:55:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 20071130055 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历,论文在投 +6 腻腻gk 2026-03-14 6/300 2026-03-16 09:39 by 闲人终南山
[考研] 321求调剂 +4 大米饭! 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:41 by Linda Hu
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +6 Ncdx123456 2026-03-13 7/350 2026-03-16 07:44 by L135790
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 309求调剂 +4 花与叶@ 2026-03-10 4/200 2026-03-14 21:26 by a不易
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy! 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 296求调剂 +3 大口吃饭 身体健 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:31 by 学员8dgXkO
[考研] 纺织、生物、化学、材料相关专业招生了 +4 耶耶业 2026-03-09 7/350 2026-03-12 19:05 by Equinoxhua
[考研] 0857环境调剂 +5 熠熠_11 2026-03-10 5/250 2026-03-11 10:59 by wang_dand
[考研] 293求调剂,一志愿陕师大生物学 +3 ??????.?.??? 2026-03-09 3/150 2026-03-11 10:02 by 学员8dgXkO
[基金申请] 提交后的基金本子,已让学校撤回了,可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
信息提示
请填处理意见