24小时热门版块排行榜    

查看: 3022  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

gemucai

木虫 (正式写手)

[求助] 用Xcrysden制作原子振动的动画的问题

gamma点的频率算出来了,输出文件为*.dynG,我用dynmat.x作用于*.dynG文件上,得到了axsf文件,但是我发现了一个问题。那就是在这个axsf文件中,虽然给出了原子所受的力,但是每一步动画对应于每一个振动模式,并且原子的相对位置都是不变的!

我想要的是把每个振动模式分开,分成很多步动画,看在每个振动模式下原子如何振动,应该如何做?谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

iamikaruk

木虫 (著名写手)


youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-11-08 19:43:49
引用回帖:
7楼: Originally posted by huazhorg at 2011-11-08 17:31:04:
pwscf 产生的动画文件为*.axsf, 不同于静态结构*.xsf, 这种文件不能被v_sim读取识别吧

pwscf的结果v_sim应该不支持吧
不过画声子简正位移的软件我觉得v_sim是最好的
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
8楼2011-11-08 19:09:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

watermall

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-06-05 22:24:18
gemucai(金币+2): 谢谢,这个我知道。如何用xcrysden读出PWSCF的声子振动输出文件是我不懂的地方。 2011-06-16 08:02:20
引用回帖:
Originally posted by gemucai at 2011-05-19 08:41:04:
gamma点的频率算出来了,输出文件为*.dynG,我用dynmat.x作用于*.dynG文件上,得到了axsf文件,但是我发现了一个问题。那就是在这个axsf文件中,虽然给出了原子所受的力,但是每一步动画对应于每一个振动模式,并 ...

用xcrysden打开axsf文件后,在display菜单里把forces选择了就行了
2楼2011-06-05 19:28:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

iamikaruk

木虫 (著名写手)


youzhizhe(金币+1): 谢谢提示。 2011-06-06 10:56:29
不妨试试用v_sim,这个动画效果比较好
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
3楼2011-06-06 00:57:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by iamikaruk at 2011-06-06 00:57:28:
不妨试试用v_sim,这个动画效果比较好

请问这是一个什么软件,在哪里可以下载?谢谢
4楼2011-11-07 10:27:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +8 SUICHILD 2026-03-12 8/400 2026-03-18 20:55 by winsuccess
[考研] 材料专业求调剂 +5 hanamiko 2026-03-18 5/250 2026-03-18 20:19 by 星空星月
[考研] 材料专硕英一数二306 +4 z1z2z3879 2026-03-18 4/200 2026-03-18 20:00 by 楤哥
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 0703化学336分求调剂 +6 zbzihdhd 2026-03-15 7/350 2026-03-18 09:53 by zhukairuo
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:05 by njzyff
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油!? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
信息提示
请填处理意见