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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 用Xcrysden制作原子振动的动画的问题
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gemucai

木虫 (正式写手)

[求助] 用Xcrysden制作原子振动的动画的问题

gamma点的频率算出来了，输出文件为*.dynG，我用dynmat.x作用于*.dynG文件上，得到了axsf文件，但是我发现了一个问题。那就是在这个axsf文件中，虽然给出了原子所受的力，但是每一步动画对应于每一个振动模式，并且原子的相对位置都是不变的！

我想要的是把每个振动模式分开，分成很多步动画，看在每个振动模式下原子如何振动，应该如何做？谢谢！
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1楼 2011-05-19 08:41:04
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watermall

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-06-05 22:24:18
gemucai(金币+2): 谢谢，这个我知道。如何用xcrysden读出PWSCF的声子振动输出文件是我不懂的地方。 2011-06-16 08:02:20
引用回帖:
Originally posted by gemucai at 2011-05-19 08:41:04:
gamma点的频率算出来了，输出文件为*.dynG，我用dynmat.x作用于*.dynG文件上，得到了axsf文件，但是我发现了一个问题。那就是在这个axsf文件中，虽然给出了原子所受的力，但是每一步动画对应于每一个振动模式，并 ...

用xcrysden打开axsf文件后，在display菜单里把forces选择了就行了
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2楼2011-06-05 19:28:18
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iamikaruk

木虫 (著名写手)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢提示。 2011-06-06 10:56:29
不妨试试用v_sim，这个动画效果比较好
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[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
3楼2011-06-06 00:57:28
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gemucai

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by iamikaruk at 2011-06-06 00:57:28:
不妨试试用v_sim，这个动画效果比较好

请问这是一个什么软件，在哪里可以下载？谢谢
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4楼2011-11-07 10:27:59
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gemucai

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by iamikaruk at 2011-06-06 00:57:28:
不妨试试用v_sim，这个动画效果比较好

我的电脑是win7 64位的，能用这个软件吗？
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5楼2011-11-07 10:42:36
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★ ★
franch(金币+3): 谢谢回帖交流 2011-11-07 16:32:40
如下是该网页的链接：
http://inac.cea.fr/L_Sim/V_Sim/index.en.html
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6楼2011-11-07 13:29:13
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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by iamikaruk at 2011-06-06 00:57:28:
不妨试试用v_sim，这个动画效果比较好

pwscf 产生的动画文件为*.axsf, 不同于静态结构*.xsf, 这种文件不能被v_sim读取识别吧
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7楼2011-11-08 17:31:04
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iamikaruk

木虫 (著名写手)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-11-08 19:43:49
引用回帖:
7楼: Originally posted by huazhorg at 2011-11-08 17:31:04:
pwscf 产生的动画文件为*.axsf, 不同于静态结构*.xsf, 这种文件不能被v_sim读取识别吧

pwscf的结果v_sim应该不支持吧
不过画声子简正位移的软件我觉得v_sim是最好的
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[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
8楼2011-11-08 19:09:38
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meng303

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z(金币-1): 鼓励交流，但交流时请选择正确的回帖方式，如果不能帮助楼主解决问题，请选择“不应助”，谢谢合作 2011-11-09 12:39:08
看到振动的动画能得到什么信息呢，请问计算出频率究竟有什么用啊，谢谢
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9楼2011-11-09 09:21:30
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gemucai

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by meng303 at 2011-11-09 09:21:30:
看到振动的动画能得到什么信息呢，请问计算出频率究竟有什么用啊，谢谢

你好，简正振动的动画直观生动，在做报告的时候可以第一时间说清楚问题。计算出频率可以对应声子谱进行振动模式的综合分析。
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10楼2011-11-16 14:26:18
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