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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 表面吸附
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者
引用回帖:
Originally posted by 胡同学 at 2011-05-26 20:16:58:
我其实也不大清楚，我用的是Medea的平台，设置好参数后，有些参数是默认的，它会自动得出那些结果。我也有些不是很清楚，但我知道那样设置没错

谢谢你，我想问你初始设置的H2分子中两个H原子的之间键长值是多少啊？
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臾兮，臾兮，何时是归期！
41楼2011-05-26 21:06:45
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-05-26 16:19:04:
通常是按键长的变化。

我想额外问您一个问题：我在计算一个H2的能量时，当初始的H－H键长为实验值0.74A时（如果点击MS上添加原子，输入坐标的那个按钮，点击确定添加第二H原子（通过键长0.74A确定这个原子的坐标）的时候，系统会出现Chosen position is  within the specified tolerance （1.0）of existing atom，这样的提示），计算的能量为－4.5eV左右（或者直接用MS上铅笔形状的那个按钮直接建H2分子，初始的键长也是0.74A，得出的能量也是-4.5eV左右）；而当初始的H－H键长比实验值略大假设为1.1A时，计算的能量为－6.2eV左右，而且这个值与其他人计算的大致相同。这是为什麽呢？
明明H－H键长的实验值为0.74A，可建模型的时候还会出现这句提示 “Chosen position is  within the specified tolerance （1.0）of existing atom”这两个H原子间会出现交叠吗？。为什麽大家还一致采用-6.2eV左右的能量，而不用-4.5eV左右的能量呢？
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臾兮，臾兮，何时是归期！
42楼2011-05-26 21:31:46
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-05-26 16:24:13:
H2的基态是非磁性的。即使你做的是自旋极化的计算，最后计算收敛到了非磁态。你检查你进行的自旋极化计算的结果，看一下总的磁矩是多少。

在计算一个H原子的能量时需要设置ISPIN＝2，如果计算H原子吸附体系的时候，是不是也需要加ISPIN＝2这一项呢？
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臾兮，臾兮，何时是归期！
43楼2011-05-26 21:36:27
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胡同学

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
kmw.8668(金币+2): 2011-05-27 10:25:25
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-05-27 10:36:12
我对MS不熟，但我觉得计算时，不能单纯的用我们认为的实际值，如键长等代进去，就像我们优化一个晶体结构 ，我们如果实际导进去的结构很符合实际情况，但我们优化后还是有变化，所以用实际值不一定正确，这只是我个人认为，但也有可能是错的，我现在计算吸附是不加spin的，但我会加spin试试，看有没有很大的不同。
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人生苦短，抓紧科研，抓紧找对象。
44楼2011-05-27 09:50:35
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者
引用回帖:
Originally posted by 胡同学 at 2011-05-27 09:50:35:
我对MS不熟，但我觉得计算时，不能单纯的用我们认为的实际值，如键长等代进去，就像我们优化一个晶体结构 ，我们如果实际导进去的结构很符合实际情况，但我们优化后还是有变化，所以用实际值不一定正确，这只是我 ...

你说的也是，但是当我把H－H键长的初始值设为实验值0.74A时，得出的一个H2的能量是-4.5eV左右，当我把初始的H－H键长值设为1.1A左右，得出的一个H2分子的能量约为-6.2eV，所以我才问你的
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臾兮，臾兮，何时是归期！
45楼2011-05-27 10:12:40
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

kmw.8668(金币+2): 谢谢 2011-05-28 12:28:41
kmw.8668(金币+3): 2011-05-31 21:47:12
引用回帖:
Originally posted by kmw.8668 at 2011-05-26 21:36:27:
在计算一个H原子的能量时需要设置ISPIN＝2，如果计算H原子吸附体系的时候，是不是也需要加ISPIN＝2这一项呢？

这要看情况。比如一个H原子吸附在graphene sheet表面的计算需要考虑进行自旋极化的计算。
通常的做法，做一个自旋极化的计算，再做一个非自旋极化的计算。比较这两种情况的能量，以及对前者计算，还需检查H所吸附在的原子以及它的最邻近原子是否有具有磁矩。
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46楼2011-05-27 19:44:42
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

kmw.8668(金币+2): 2011-05-28 12:28:51
引用回帖:
Originally posted by kmw.8668 at 2011-05-26 21:31:46:
我想额外问您一个问题：我在计算一个H2的能量时，当初始的H－H键长为实验值0.74A时（如果点击MS上添加原子，输入坐标的那个按钮，点击确定添加第二H原子（通过键长0.74A确定这个原子的坐标）的时候，系统会出现 ...

对H2, 建议做2个H原子间距(d) 随总能(E)变化的曲线，找出能量的最低值，得到H2在平衡位置时的键长。 d~E.

或对H2做结构优化，直接优化出H2的键长。然后此键长的H2计算总能，那此总能去计算吸附能等。
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47楼2011-05-27 19:50:38
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-05-27 19:44:42:
这要看情况。比如一个H原子吸附在graphene sheet表面的计算需要考虑进行自旋极化的计算。
通常的做法，做一个自旋极化的计算，再做一个非自旋极化的计算。比较这两种情况的能量，以及对前者计算，还需检查H所 ...

"比较这两种情况的能量，以及对前者计算.还需检查H所吸附在的原子以及它的最邻近原子是否有具有磁矩。"这里说检查H所吸附在的原子及它的最近邻原子是否有磁矩，怎样判断呢？我通常计算都没有考虑磁矩这方面的，除非是一些极特殊的元素啊，请指教！
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臾兮，臾兮，何时是归期！
48楼2011-05-28 13:40:21
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