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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者

[求助] 表面吸附

1.作表面吸附的时候,如果吸附的是一个分子O2,那O-O键长该如何确定呢,就是在建模的时候,是把O2分子作为一个整体放上去还是将O原子一个一个放上呢?
2.文献中常常出现coverge 是多少ML,怎样确定覆盖面是多少呢?
3.文献中还会出现“absorbs at a two-fold (or three-fold) site" 这个又是怎样理解呢?
请大家帮帮忙!重金谢谢!
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臾兮,臾兮,何时是归期!
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-05-26 16:19:04:
通常是按键长的变化。

我想额外问您一个问题:我在计算一个H2的能量时,当初始的H-H键长为实验值0.74A时(如果点击MS上添加原子,输入坐标的那个按钮,点击确定添加第二H原子(通过键长0.74A确定这个原子的坐标)的时候,系统会出现Chosen position is  within the specified tolerance (1.0)of existing atom,这样的提示),计算的能量为-4.5eV左右(或者直接用MS上铅笔形状的那个按钮直接建H2分子,初始的键长也是0.74A,得出的能量也是-4.5eV左右);而当初始的H-H键长比实验值略大假设为1.1A时,计算的能量为-6.2eV左右,而且这个值与其他人计算的大致相同。这是为什麽呢?
明明H-H键长的实验值为0.74A,可建模型的时候还会出现这句提示 “Chosen position is  within the specified tolerance (1.0)of existing atom”这两个H原子间会出现交叠吗?。为什麽大家还一致采用-6.2eV左右的能量,而不用-4.5eV左右的能量呢?
臾兮,臾兮,何时是归期!
42楼2011-05-26 21:31:46
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xiao72379

木虫 (正式写手)

宅男甲

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zzy870720z(金币+3): 谢谢指教 2011-05-16 14:24:20
zzy870720z(1ST强帖+1): 已审核 2011-05-16 14:24:50
cenwanglai(金币+5): 2011-05-16 16:56:20
1)建模的时候将O2整体放上去  至于吸附后的键长 由vasp优化确定
2)ML就是monolayer的意思 由你覆盖的原子数对比表层原子数
可以参看下这篇文章的FIG3 a)图  THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 133, 034701 2010 Lithium transport at silicon thin film: Barrier for high-rate capability anode
3)“absorbs at a two-fold (or three-fold) site"应该是说吸附于2配位(或者3配位)的位子
天行健君子以自强不息
2楼2011-05-16 11:08:15
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者

引用回帖:
Originally posted by xiao72379 at 2011-05-16 11:08:15:
1)建模的时候将O2整体放上去  至于吸附后的键长 由vasp优化确定
2)ML就是monolayer的意思 由你覆盖的原子数对比表层原子数
可以参看下这篇文章的FIG3 a)图  THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 133, 034701 2 ...

谢谢指导!那建模的时候怎样把O2整体放上表面呢?这个牵扯到O-O键长啊?
臾兮,臾兮,何时是归期!
3楼2011-05-16 15:20:09
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xiao72379

木虫 (正式写手)

宅男甲

★ ★ ★ ★ ★
zzy870720z(金币+5): 楼主奖励 2011-05-17 21:09:29
引用回帖:
Originally posted by kmw.8668 at 2011-05-16 15:20:09:
谢谢指导!那建模的时候怎样把O2整体放上表面呢?这个牵扯到O-O键长啊?

这个我不知道你的体系有木有可以参考的文献   到底什么构型稳定。
要是你不知道的话 就多试试  这里计算量会有点大  结构优化后 可能O2是平行表面的,或者垂直表面,又或者都不是都是可能的。什么构型是最稳定的 你比下Binding Energy就出来了  至于初始的键长就用O2的实验值吧  剩下的交给vasp弛豫了
天行健君子以自强不息
4楼2011-05-16 15:52:28
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