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huying15

铜虫 (小有名气)

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[求助] 怎样加快ONIOM计算的速度

我想问下，我用PM3计算得到药物和环糊精对接的最佳构型，有6个方向，再用ONIOM对最佳的构型进行优化，有的所用时间较快，就1,2天；但有些算了4,5天没好，我想问下是什么原因，还有有什么方法加快计算的速度，请高手指教下，下面是输入文件的关键词
%mem=1000MB
%rwf=a,1990mb,b,1990mb,c,1990mb,d,1990mb,e,1990mb
# opt=tight oniom(b3lyp/6-31+g(d):pm3) geom=connectivity pop=minimal test

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1楼2011-05-15 19:26:03

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beefly

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【答案】应助回帖

huying15(金币+4): 谢谢 2011-05-16 13:15:33

如果是单参考体系，blyp（以及其他纯gga）和b3lyp的结果一般没有定性差别。并不是说非要用blyp，任何非杂化泛函都可以，可以先做些测试选个最好的。

auto是gaussian的一个关键词，表示自动生成密度拟合基组。

如果大部分计算并不是停留在b3lyp上（包括b3lyp梯度计算），则没必要改。