24小时热门版块排行榜

返回列表

Jfreda

铁虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 21.8
散金: 73
帖子: 91
在线: 31.5小时
虫号: 870275
注册: 2009-10-13
专业: 药物设计与药物信息

[求助] 能量优化时出错

大家好，我在对体系进行能量优化时，老是出现如下的错误：
Steepest Descents:
Tolerance (Fmax) =  1.00000e+02
Number of steps =       10000
Stepsize too small, or no change in energy.
Converged to machine precision,
but not to the requested precision Fmax < 100
Double precision normally gives you higher accuracy.
writing lowest energy coordinates.
Steepest Descents converged to machine precision in 618 steps,
but did not reach the requested Fmax < 100.
Potential Energy  = -3.6909910e+06
Maximum force    =  3.1073354e+04 on atom 25609
Norm of force    =  2.0544344e+02
改变em.mdp中的参数emtol,emstep,dt结果还是一样，初始结构检查了也没有错。
我现在用的是oplsaa立场,其中的ffoplsaabon.itp, ffoplsaanb.itp文件时我从网上当下来的，有关于磷脂的部分，上述的结果会不会跟这些参数文件的设置有关呢，请大家帮忙分析一下，谢谢！

回复此楼