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fineren

木虫 (正式写手)

[求助] 请问优化两层相同的分子用什么方法?(两层分子有pi-pi作用)

比如两层相同的金属卟啉,优化其pi-pi作用,两层的距离,通常用什么方法?谢谢
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖


fineren(金币+2): 2011-05-12 20:55:35
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-12 20:56:15
我全优化二体苯:

用hf/6-311++g(d,p),二苯相距从3.7优化至6.88875(还在继续拉长,人工中止)

用pbepbe/6-31+g(d),二苯相距从3.7优化至4.84837

用b97d/6-31+g(d),二苯相距从3.7优化至3.99969

我参照C在晶体中的平均范德华半径,认为b97d还比较靠谱。

gjf文件命令行跟普通的DFT计算一样。b97d只在G09才有。
4楼2011-05-12 20:43:17
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-12 12:27:29
fineren(金币+2): 能详细点吗?有参考文献吗?谢谢 2011-05-12 19:42:43
我近来也试作优化其pi-pi作用,两层的距离,认为G09中的b97d比较靠谱。当然还会有更合用的。
2楼2011-05-12 10:22:14
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fineren

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-05-12 10:22:14:
我近来也试作优化其pi-pi作用,两层的距离,认为G09中的b97d比较靠谱。当然还会有更合用的。

能详细点吗?另外有参考文献吗?谢谢
gjf文件命令行是怎么写的?跟普通的DFT计算一样吗?
3楼2011-05-12 19:43:53
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fineren

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-05-12 20:43:17:
我全优化二体苯:

用hf/6-311++g(d,p),二苯相距从3.7优化至6.88875(还在继续拉长,人工中止)

用pbepbe/6-31+g(d),二苯相距从3.7优化至4.84837

用b97d/6-31+g(d),二苯相距从3.7优化至3.99969

我参 ...

非常感谢。不过4A还是挺远的,可惜我不能用g09计算。
两个分子,gjf文件电荷和自旋多重度还是 0 1 ?
5楼2011-05-12 20:54:59
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