24小时热门版块排行榜    

查看: 3514  |  回复: 29

szylnl

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5): Good!我以前也差不多,不过Taq酶是一起加了的,95℃用5分钟。 2011-05-12 01:09:22
syn1985(金币+1): 谢谢 2011-05-12 09:13:31
前面都差不多,我做菌落PCR是先把引物和mix加好,然后用牙签挑一下单菌落,放在PCR管里搅一下,然后在PCR仪上设计一个95℃,10分钟的程序,之后再加上Taq酶,不知道你这样做会怎样。
用百分之百的努力去做每件事
11楼2011-05-11 22:41:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by syn1985 at 2011-05-11 21:03:16:
我也是用沸水裂解了啊 呵呵

那就不清楚了,我一般阳性克隆率在80%吧,你一个都挑不到未免也太不走运了吧,你一般一次挑几个菌落啊?如果是挑白色菌落按理说不应该啊,建议你PCR的时候做一个阳性对照,我感觉你的问题是不是出在PCR上了啊!
12楼2011-05-11 23:47:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

glucidum

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
dhd997(金币+3): 热心哦 2011-05-12 12:01:10
引用回帖:
Originally posted by syn1985 at 2011-05-11 18:37:29:
我用的是rtaq 所以可以直接做TA的,平板上长出来的克隆很多,可是随机挑取5个都是假阳性的 而且这5个还是靠近蓝斑旁边挑的, 我不太懂你为啥说克隆多就表明连接反应没问题啊 我觉得连接反应是没问题 但是全是T ...

TA连接会有自连现象,有自连就说明酶什么的都是正常的,否则自连也无法发生的。
还有两个问题或许你也要注意一下:
(1)你的PCR特异性好不好,纯化后有没有小片段产物?如果有的话也会发生插入,而且理论上将小片段的效率要高于大片段。
(2)你的目的片段只有200bp,你看一下插入后对半乳糖苷酶alpha亚基的读码框有没有影响,如果会发生移码,那确定应该是白斑;如果不会造成移码,那你就多挑几个蓝斑试试。
13楼2011-05-12 06:23:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

syn1985

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by szylnl at 2011-05-11 22:41:17:
前面都差不多,我做菌落PCR是先把引物和mix加好,然后用牙签挑一下单菌落,放在PCR管里搅一下,然后在PCR仪上设计一个95℃,10分钟的程序,之后再加上Taq酶,不知道你这样做会怎样。

我以前也这么做过 不过那是菌斑比较大的情况下 要不然的话就挑没了
14楼2011-05-12 09:09:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

syn1985

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by glucidum at 2011-05-12 06:23:25:
TA连接会有自连现象,有自连就说明酶什么的都是正常的,否则自连也无法发生的。
还有两个问题或许你也要注意一下:
(1)你的PCR特异性好不好,纯化后有没有小片段产物?如果有的话也会发生插入,而且理论上将小片 ...

我PCR产物一条带 是切胶回收 不是纯化的
15楼2011-05-12 09:12:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sfb1020

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

syn1985(金币+1): 刚开始做这种实验的时候我也觉得很好连 随着时间的推移 做的越多发现越难连 2011-05-12 11:26:47
应该是pcr不好P,你可以粗提质粒跑个电泳看看,和阴性对照对比一下。
一般16度过夜肯定能连上,很好连的。
16楼2011-05-12 09:40:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

syn1985

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by sfb1020 at 2011-05-12 09:40:29:
应该是pcr不好P,你可以粗提质粒跑个电泳看看,和阴性对照对比一下。
一般16度过夜肯定能连上,很好连的。

我用的是兼并引物 宝生物的RV和M4 退火温度设了55度  我买宝生物这个引物的时候上面也没写要多少度退火 我记得以前老师说过这个什么温度都能P出来 所以就设了个一般的温度 也不晓得是不是温度不太合适
17楼2011-05-12 11:25:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

syn1985

木虫 (正式写手)

我这次排除了x-gal IPTG还有Amp的问题 我挑了10个做PCR 结果还是全都假阳性 真想不通为什么
18楼2011-05-13 16:35:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuxia82012

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

syn1985(金币+1): 谢谢 我这次重新P了 也回收后跑了胶 上样2ul 能看到条带 我觉得这浓度应该是可以的吧 2011-05-16 13:30:09
你把回收的片段跑胶看看浓度,搞不好是没回收到
在等待中涅槃重生
19楼2011-05-13 16:49:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

太极拳

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

syn1985(金币+1): 宝生物的T载体不稳定啊 2011-05-16 13:30:32
我从不做菌落PCR,每次都是提质粒做酶切,而且我用的国产全式金的Peasy-T1载体,200bp片段也就用个25度5分钟就连上了,并且是amp和kan双抗载体,不用蓝白斑得到的菌落基本全是阳性。
20楼2011-05-14 13:49:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 syn1985 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-15 5/250 2026-03-15 20:38 by Logic2024
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +3 Liwangman 2026-03-15 3/150 2026-03-15 18:16 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 313分生物学求调剂 +6 Yyt杨1 2026-03-09 8/400 2026-03-14 03:00 by JourneyLucky
[考研] 085600求调剂 +3 a邵星池 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:32 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +6 yfihxh 2026-03-09 6/300 2026-03-14 01:18 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +7 超级伊昂大王 2026-03-10 7/350 2026-03-14 00:49 by JourneyLucky
[考研] 求调剂,一志愿江南大学环境工程085701 +3 Djdjj12 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:31 by JourneyLucky
[考研] 0805,333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 293求调剂,一志愿陕师大生物学 +3 ??????.?.??? 2026-03-09 3/150 2026-03-11 10:02 by 学员8dgXkO
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 0703化学调剂 +3 三dd. 2026-03-10 3/150 2026-03-10 15:45 by peike
[考研] 327分求调剂086 +4 西红柿?小帅 2026-03-09 7/350 2026-03-10 14:47 by ruiyingmiao
信息提示
请填处理意见