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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者

[求助] 关于原子位置的问题

做表面吸附建模型的时候,被吸附原子的位置怎样确定呢?也就是被吸附原子具体该放在那些位置呢?我看文献上说有桥位、顶位、空位,这些具体都指的是哪些位置呢,怎样把原子放在这些位置呢?知道的虫友请帮帮忙,金币酬谢!
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臾兮,臾兮,何时是归期!
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


kmw.8668(金币+10): 5 2011-05-15 09:49:57
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-16 20:25:54
顶位(top site),就是吸附原子在表面层原子的正头顶上的位置,即吸附原子的x,y坐标与它最近的表面层原子的x,y坐标一样,只是z坐标不同,相差一个原子间距d。
桥位(bridge site), 就是吸附原子在两个表面原子的连线的中点的上位,假设两个表面原子的坐标分别为(x1_s, y1_s, z1_s)和(x2_s, y2_s, z2_s= z1_s),那么在桥位的吸附原子的坐标为( (x1_s + x2_s)/2, (y1_s+y2_s)/2,  z1_s +d)。
空位(hollow site),就是吸附原子在表面原子所构成的正三角形、四边形、或六边形的中心位置的头顶位。根据两点的中点公式,可以很容易确定空位位置的坐标。
9楼2011-05-14 22:11:35
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
franch(金币+3): 谢谢回帖交流 2011-05-16 20:27:12
引用回帖:
Originally posted by kmw.8668 at 2011-05-16 08:51:13:
非常感谢,你说的很明白!"相差一个原子间距d",这个d指的是表面原子的d还是吸附原子的d呢?这个我不是很明白!
还有一点,我看文献上面都说coverge是用“多少ML”表示,这个coverge表示的是什麽意思 ...

这里的d只是代表一个初始值而已。

coverge指的是吸附物的覆盖度。建议读读有关的表面化学或表面化学书,了解一些最基本的东西。
http://www.uksaf.org/tutorials.html
http://www.chem.qmul.ac.uk/surfaces/scc/

比如最小的表面原胞内含一个吸附物,那覆盖度就是1,如果 2x2的超原胞里含一个吸附物,那覆盖度就是1/4。其他情况依次类推。
16楼2011-05-16 19:32:12
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