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hunanren7868

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 悬赏:求教一个分子的构型

请问各位高手, 这个分子A的空间构型是什么样的额,文献上只说是由二甲基组成,但我建模的时候不知道怎么样建立它的初始构型,B是A中的一部分,请问B中的4个碳原子是在一个平面上的吗?如果哪位熟悉这个分子的大侠能给出它的初始坐标,万分感谢!
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hunanren7868

铁杆木虫 (小有名气)

太感谢您啦,请问这个是高斯里面自带的还是您非常熟悉这个体系,这时优化后的最优构型么,还是用它作为初始构型去优化?
3楼2011-05-11 08:45:46
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
hunanren7868(金币+40): 谢谢啦 2011-05-11 08:45:56
gmy1990(金币+5): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-11 09:14:17
1.gjf对应你左边的分子
2.gjf对应你右边的分子
用GaussView打开
2楼2011-05-11 08:40:01
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by hunanren7868 at 2011-05-11 08:45:46:
太感谢您啦,请问这个是高斯里面自带的还是您非常熟悉这个体系,这时优化后的最优构型么,还是用它作为初始构型去优化?

刚才忘了一个文件
右侧的物质有顺反异构体(注意我说的不是船式和椅式的互变异构哦)
4楼2011-05-11 08:48:35
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

当然不是优化后的构型 你自己去优化 而且我在gjf里没写优化命令 你自己去写
我对你的体系毫不熟悉
提问前先看看这个吧
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
5楼2011-05-11 08:50:36
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