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wkl1984

金虫 (小有名气)

[求助] 如何将下面的序列连接在一起?

下面给出上下游引物的序列和连接子序列,大家帮忙分析一下如何将这三段片段连接在一起,组成共同的一段片段?
VH上游游引物:CCT CCA CCA CTC GAG ACG ACG ACT TCA ACG CCT GG
VH 下游引物:GTA TAC GCA ACT GCG GCC CAG CCG GCC ATG GCC GAG GWG  AAG CTG GTG GAG TCY GG

连接子:GGT GGA GGC GGT TCA GGC GGA GGT GGT TCT GGC GGT GGC GGA TCG

Vk上游引物:GAG TCA TTC TCG ACT TGC GGC CGC ACG TTT GAK YTC CAG CTT GGT CCC
VK下游引物:ACC GCC TCC ACC AGT GCA CTT GCC ATY GTG CTG ACC CAG AST CC
兼并碱基代码:Y=C/T   R=A/G    S=C/G   W=A/T  K=T/G
是直接将着3段片段放在同一PCR反应体系中,按照模板对待,还是先将VK和连接子进行PCR扩增后,再与VH进行PCR拼接?该如何操作呢?扩增的引物如何选择呢?
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liuhedong1817

木虫 (正式写手)

hello

【答案】应助回帖

做PCR实验要一步一步来,步子跨大了,容易扯着蛋啊!
老婆的头像
5楼2011-05-08 20:09:00
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yabxxh

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

wkl1984(金币+1): 2011-05-08 19:29:58
这个问题你要说清楚啊,这三个片段到底是什么关系,在哪里重合?我看了半天没看出来那个连接子有什么用。
2楼2011-05-08 08:44:09
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wkl1984

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yabxxh at 2011-05-08 08:44:09:
这个问题你要说清楚啊,这三个片段到底是什么关系,在哪里重合?我看了半天没看出来那个连接子有什么用。

就是将 VK链的上游引物和连接子之间有重复序列,连接子与VH链的下游引物之间有重叠区,我现在不知道怎样将这3段组成一个整体?
3楼2011-05-08 12:18:24
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

wkl1984(金币+1): 2011-05-08 19:30:11
先部分,再整体。比如你说的先将VK和连接子进行PCR扩增后,再与VH进行PCR拼接。全加进去引物太多了,容易错配。
4楼2011-05-08 15:04:48
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