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zzhlibin

银虫 (小有名气)

[求助] 敢问众位大侠每个生物的GAPDH序列都是一样的吗?

最近想做一个昆虫的荧光定量PCR,现在急需一个内参基因,不知道每个生物的GAPDH是否一致,如果一致的的话,我就可以用已有的引物进行扩增了,如果不同就得重新设计引物了!
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314300420

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
lstt09nk(金币+2): 感谢参与 2011-05-05 18:25:46
zzhlibin(金币+5): 1 2011-05-07 10:04:50
种属相同的话就是一样的,不同动物是有差异的
2楼2011-05-05 17:29:31
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
lstt09nk(金币+2): 感谢参与 2011-05-07 19:07:28
建议去NCBI下载多物种GAPDH序列,回来利用软件进行比对,这样比较直观,可以根据保守区设计引物。
3楼2011-05-06 20:31:44
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zzhlibin

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 314300420 at 2011-05-05 17:29:31:
种属相同的话就是一样的,不同动物是有差异的

您的意思是同一个属间也可以是一样的吗?
4楼2011-05-07 10:06:40
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zzhlibin

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gaoyang636 at 2011-05-06 20:31:44:
建议去NCBI下载多物种GAPDH序列,回来利用软件进行比对,这样比较直观,可以根据保守区设计引物。

谢谢大侠!
5楼2011-05-07 10:08:29
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mamadexiao

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

呵呵,当然不一样啊,小鼠和大鼠都不一样呢,,,,虽说,这俩本就不一样~
你要用通用引物的话,要先做个序列比对,在保守区设计就OK
6楼2011-05-08 13:21:57
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jhu132llh

荣誉版主 (知名作家)

大洪

【答案】应助回帖

比较保守
但是估计不完全一样
尤其是跨种属时候
青春的岁月,我们身不由己,只因这胸中燃烧的梦想!
7楼2011-05-08 18:39:14
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yabxxh

木虫 (正式写手)

呵呵,我承认我是进来学习的
8楼2011-05-09 10:05:43
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adslye

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

内参基因的选择有很多,没必要盯着GADPH 。
这方面的文献很多,你可以去看看。NCBI上你也可以找你那生物的GADPH,没有全序列应该有EST序列的,自己设计一对引物也不麻烦。
9楼2011-05-09 19:00:27
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