应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » MVD docking后的小分子和蛋白的complex为啥在pymol里不能完全显示？
152/2返回列表上一页12
查看: 3420  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chemozhang

木虫 (正式写手)
就几个金币，整天叫着给退，有意思吗
小木虫不是你保姆
赞一下 回复此楼
故地如重游月圆更寂寞
11楼2011-09-05 21:44:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pkuchemistry

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by chemozhang at 2011-09-05 21:44:43:
就几个金币，整天叫着给退，有意思吗
小木虫不是你保姆

我哪有整天叫着要退？我早就忘记这回事情了。他把我的帖子收录成精华，我只是觉得不算精华啊！看清楚别人的意思先！！！！
赞一下 回复此楼
书中自有黄金屋，书中自有颜如玉。
12楼2011-09-06 12:08:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shuzhen

新虫 (小有名气)
★
御剑江湖(金币+1): 鼓励 2011-09-21 21:37:57
我想用MVD做docking，第一次接触这个软件，看了附带的厚厚的英文说明书还是不太明白，有些问题想咨询一下，不知道可否帮我解答一下啊，因为比较着急把这个弄明白，多谢多谢，希望能大体跟我讲一下。我的疑惑有：1 docking之前在制备小分子和受体的时候，小分子的能量能优化吗？在哪优化啊？
2 docking的时候能不能控制小分子的构型不改变，而保持其最低能量，像symbl中的一样。
3 分析结果的时候是不是按rerank score来排序结合的好坏啊？
希望能帮我看一下这几个问题，在线等~谢谢~
赞一下(1人) 回复此楼
13楼2011-09-21 16:31:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pkuchemistry

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by shuzhen at 2011-09-21 16:31:30:
我想用MVD做docking，第一次接触这个软件，看了附带的厚厚的英文说明书还是不太明白，有些问题想咨询一下，不知道可否帮我解答一下啊，因为比较着急把这个弄明白，多谢多谢，希望能大体跟我讲一下。我的疑惑有：1 ...

MVD不肿么样，玩玩还可以，如做学术研究，还是autodock更靠谱些。
赞一下 回复此楼
书中自有黄金屋，书中自有颜如玉。
14楼2011-09-21 19:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

苏祖清

铜虫 (小有名气)
先用autodock生成蛋白和受体的结合的pdbqt文件,再用autodock打开pdbqt文件,另存为pdb文件,再用pymol打开就行了.成功的话,谢谢采纳
赞一下 回复此楼
我来学学
15楼2013-04-02 18:11:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pkuchemistry 的主题更新
152/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 10:26 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 5/250 2026-09-29 09:52 by JzYBbHIXWSrW
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-29 09:24 by JzYBbHIXWSrW
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-29 09:18 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[有机交流] 同一个分子，一条来自文献，一条来自AI——不告诉你答案，你会选哪条？ +3 tianxiaoxian 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:44 by tianxiaoxian
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:28 by ez6fGg9abYaj
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-28 22:21 by ez6fGg9abYaj
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:15 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意！ +7 zju2000 2026-09-26 8/400 2026-09-28 16:42 by beefly
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭