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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生

引用回帖:
Originally posted by shiyiwenren at 2011-05-04 15:37:56:
我发邮件问了这篇论文的作者了,他给出的做法如下:

1. First convert the diamond structure into primitive cell using the Build module in Material Studio.
2. Change the lattice parameter to a/1. ...

谢谢了哈,我试试吧,可以的话告诉你哈!
相信自己,努力拼搏!
11楼2011-05-04 20:38:30
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-05-05 12:05:43
引用回帖:
Originally posted by dragon5061 at 2011-05-04 20:38:30:
谢谢了哈,我试试吧,可以的话告诉你哈!

做出来的话,可以把此帖UPDATE下。。。。
好好学习,天天向上。
12楼2011-05-05 10:42:32
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dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生

引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-05-05 10:42:32:
做出来的话,可以把此帖UPDATE下。。。。

好的,没得问题。
相信自己,努力拼搏!
13楼2011-05-05 20:02:31
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dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生

真是惭愧,折腾了一天,还是没弄出来,不知道楼主进展如何?
相信自己,努力拼搏!
14楼2011-05-06 09:03:36
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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+5): 谢谢分享你的问题 2011-08-29 18:15:40
引用回帖:
Originally posted by dragon5061 at 2011-05-06 09:03:36:
真是惭愧,折腾了一天,还是没弄出来,不知道楼主进展如何?

我也还没有做出来,我尝试用这种方法来将联苯基团取代C-C键,但是中间碰到一个小问题,现在把我的做法贴出来,希望有人能帮忙解决。
1. 按照之前所说将diamond的晶胞转化成原胞,并将原胞的晶胞长度改成a=16.9425

2.新建一个xsd文件,在文件中画出联苯基团,两端各连有一个甲基,如下图所示

并将整个大的基团中的两端甲基之间的距离测量出来,与原胞中C-C键的长度做对比,C(CH3)-C(phenyl),C(phenyl)-C(phenyl)的长度也测量出来。
3.将原胞中的C-C键删除,计算C-C键的长度以及大基团中甲基间的距离的比值,将插入C(CH3)-C(phenyl),C(phenyl)-C(phenyl)的长度按照该比值计算出实际各键的长度
4.根据各键的长度,以及原胞中C-C键两头C原子的分数坐标(我尝试是选择的两个C原子的坐标为(0,0,0)和(0.25,0.25,0.25))计算出插入联苯基团时各原子的分数坐标。但是我现在只做到将一条线上的C原子插入,对于不在一条线上的C和H原子我无法计算出它们的分数坐标所以还没有插入。

我在计算各个原子的分数坐标的时候,对于与原胞中两个C原子在一条直线上的C原子的分数坐标的计算,用的方法是向量的共线原理和它们的长度比,但是对于与它们不在一条线上的其他原子,我现在只想到用向量的夹角,向量的长度来计算,但是这样的话对于x,y,z三个空间坐标来说只得到三个方程,还缺少一个才能确定,我在这一步中卡住了,希望有人能给予指点。
15楼2011-05-12 09:32:54
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changlianze

木虫 (正式写手)

引用回帖:
15楼: Originally posted by shiyiwenren at 2011-05-12 09:32:54:
我也还没有做出来,我尝试用这种方法来将联苯基团取代C-C键,但是中间碰到一个小问题,现在把我的做法贴出来,希望有人能帮忙解决。
1. 按照之前所说将diamond的晶胞转化成原胞,并将原胞的晶胞长度改成a=16.94 ...

有一个问题请教:金刚石网络应该是立方晶系的,但看你所用的晶胞貌似是三斜的,这个没有影响吗?
16楼2011-08-29 11:10:02
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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-08-29 18:15:46
引用回帖:
16楼: Originally posted by changlianze at 2011-08-29 11:10:02:
有一个问题请教:金刚石网络应该是立方晶系的,但看你所用的晶胞貌似是三斜的,这个没有影响吗?

上图中显示的是金刚石的原胞,你将金刚石的晶胞转化成原胞就是这样的
17楼2011-08-29 13:53:56
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changlianze

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
谢谢回答。那楼主的建模最后成功没?
18楼2011-08-29 15:53:47
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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
18楼: Originally posted by changlianze at 2011-08-29 15:53:47:
谢谢回答。那楼主的建模最后成功没?

没有,就卡在那一步了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

19楼2011-08-29 16:55:08
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changlianze

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
19楼: Originally posted by shiyiwenren at 2011-08-29 16:55:08:
没有,就卡在那一步了

能不能不指定原子坐标,或大致放在一个位置,因为后面不是还要结构优化吗?在优化过程中进行苯环结构限定可以吗?
我不是做计算的,是做COF合成的,刚刚开始关注建模,还请多多指教!
20楼2011-08-29 18:12:38
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