24小时热门版块排行榜    

查看: 1684  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yuer1986

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因表达谱怎么标准化

Sample Text我想求助有谁知道“基因表达谱怎么标准化”
最好是有一个具体的过程教怎么去做(一个PDF或者一篇关于基因表达谱怎么标准化的文章)
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

JunJr

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

如果有经费,直接买genespring之类芯片的商业软件,按流程下来。这个很容易。
但过度依靠这类软件,对个人能力的发展不利。

如果自定义分析,要根据你的芯片类型和需要的方法,用R加bioconductor packages分析。

当然,如下这篇经典的方法学比较的paper需要仔细读读。被引用了2300多次。
A comparison of normalization methods for high density oligonucleotide array data based on variance and bias

可以在如下链接直接下载
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/19/2/185.short
4楼2011-05-01 09:05:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

agtc

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你是要做神马啊,基因芯片还是?如是基因芯片可以选用用housekeepinggene作为参照,也只是相对的标准。
慢慢的走是为了走的更远!
2楼2011-04-21 17:20:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

carval

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

这是一个芯片归一化的总结ppt
http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=11023730k060b0w6e2aiccsx
3楼2011-04-22 09:18:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sp1613

金虫 (小有名气)

正需要这些资料,替楼主感谢楼上各位高人!!!
5楼2012-03-07 15:26:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程专硕283求调剂 5+3 ,!? 2026-03-02 3/150 2026-03-02 09:04 by 材子momo
[考研] 0856材料与化工,270求调剂 +7 YXCT 2026-03-01 7/350 2026-03-02 08:29 by houyaoxu
[考研] 材料复试调剂 +4 学材料的点 2026-03-01 5/250 2026-03-02 08:26 by houyaoxu
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 13/650 2026-03-02 07:27 by 好好好1233
[考研] 欢迎采矿、地质、岩土、计算机、人工智能等专业的同学报考 +4 pin8023 2026-02-28 6/300 2026-03-02 06:35 by 汪!?!
[考研] 284求调剂 +8 天下熯 2026-02-28 8/400 2026-03-02 00:15 by 暮雨星晴
[基金申请] 本子写完了,给DS兄弟看了,得了92分 +3 Doma 2026-03-01 7/350 2026-03-02 00:00 by jnzsy
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +3 Qwertyuop 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:18 by aaadim
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 281求调剂 +4 2026计算机_诚心 2026-03-01 7/350 2026-03-01 17:20 by 2026计算机_诚心
[考研] 化工专硕342,一志愿大连理工大学,求调剂 +3 kyf化工 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:49 by yywzz
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考研] 311求调剂 +9 南迦720 2026-02-28 10/500 2026-03-01 10:55 by sunny81
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见