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yuer1986

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因表达谱怎么标准化

Sample Text我想求助有谁知道“基因表达谱怎么标准化”
最好是有一个具体的过程教怎么去做(一个PDF或者一篇关于基因表达谱怎么标准化的文章)
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carval

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

这是一个芯片归一化的总结ppt
http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=11023730k060b0w6e2aiccsx
3楼2011-04-22 09:18:16
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查看全部 5 个回答

agtc

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你是要做神马啊,基因芯片还是?如是基因芯片可以选用用housekeepinggene作为参照,也只是相对的标准。
慢慢的走是为了走的更远!
2楼2011-04-21 17:20:16
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JunJr

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

如果有经费,直接买genespring之类芯片的商业软件,按流程下来。这个很容易。
但过度依靠这类软件,对个人能力的发展不利。

如果自定义分析,要根据你的芯片类型和需要的方法,用R加bioconductor packages分析。

当然,如下这篇经典的方法学比较的paper需要仔细读读。被引用了2300多次。
A comparison of normalization methods for high density oligonucleotide array data based on variance and bias

可以在如下链接直接下载
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/19/2/185.short
4楼2011-05-01 09:05:21
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sp1613

金虫 (小有名气)

正需要这些资料,替楼主感谢楼上各位高人!!!
5楼2012-03-07 15:26:40
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