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【求助/交流】求助PAUP(windows版本)构建NJ树时的输入命令的问题
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最近用PAUP构建了NJ树,因为对这方面不太懂,最后发现输入的命令可能有问题,分支长度没有区别,并且substitution/site值也不对,别人文献里基本都是0.01,而我的确是10,我用的命令见下,求高人指导。 ------------------------------------------------------------- Set criterion=distance dset distance=hky85 Outgroup FJ883747 NJ Bootstrap nreps=1000 search=nj savetrees file=N.tre brlens=yes savebootp=both from=1 to=2 再输入NJ后可以看见树的分支长度是不一样的,但用bootstrap评估完后就一样了,是不是我应该更改什么命令呢?求解答 |
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