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JessieDai

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有人在做焦磷酸测序么?希望得到大虾的帮助 已有10人参与

实验室想做高通量测序,貌似一般就是那个焦磷酸测序吧,由于没找到太多的关于这方面的知识,基本处于什么都不清楚的状态,希望做这个的大虾能够介绍一下或者给点相关的资料,O(∩_∩)O谢谢
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二代测序 高通量测序

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gaoyang636

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
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看天(金币+4): 有理 2011-04-06 18:19:57
1 高通量不仅仅是焦磷酸测序;
2 罗氏的454是焦磷酸,但是通量比其他的二代低,每个RUN需要的银子也多,好处是读长很长(400bp+);
3 Qiagen的焦磷酸测序还不是一般意义上的高通量二代测序,虽然测序原理是一样的,但是通量更小,且一般是需要自己选择目的基因并设计引物的;
4 LZ即便打算要做高通量了,也没必要自己去设计protocol,需要做的是选择适合自己的方案,然后会有现成的protocol,比你自己摸索的强……
7楼2011-04-06 18:12:34
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janyan

银虫 (初入文坛)

★ ★ ★
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看天(金币+2): 鼓励交流 2011-04-06 12:57:50
那天QIAGEN公司的来讲了一次焦磷酸测序,有不少解决方案,而且貌似给他们做也省钱,你可以试试,我还没做过焦磷酸,只能提供这点信息咯,希望有用呵呵
2楼2011-04-05 23:34:35
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JessieDai

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by janyan at 2011-04-05 23:34:35:
那天QIAGEN公司的来讲了一次焦磷酸测序,有不少解决方案,而且貌似给他们做也省钱,你可以试试,我还没做过焦磷酸,只能提供这点信息咯,希望有用呵呵

谢谢了哦,我也是听一个老师讲了一次而已,是要送给公司做,但是前面的PCR还是要自己做的,所以还要自己设计个试验方法。
3楼2011-04-06 08:42:39
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家

★ ★ ★
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看天(金币+2): 鼓励回答 2011-04-06 12:58:03
嗯...对于不熟悉高通量测序,但又想做一些这方面实验的童鞋们,我的建议是先好好了解一下这项技术,想清楚实验目的是什么,测序要获得哪些主要信息。因为这个玩意儿少说也要几万块(小RNA之类不算),要测的样本多,几十万上百万的花费也是有可能的。所以先自己想明白了,才好和测序公司谈。
最后,更正一点,高通量测序可不止焦磷酸测序一种,具体的可以看看下面的资料~

http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=109434909uls2xeuwys00rq4
4楼2011-04-06 09:29:53
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