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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助】有人在做焦磷酸测序么？希望得到大虾的帮助
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JessieDai

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有人在做焦磷酸测序么？希望得到大虾的帮助 已有10人参与

实验室想做高通量测序，貌似一般就是那个焦磷酸测序吧，由于没找到太多的关于这方面的知识，基本处于什么都不清楚的状态，希望做这个的大虾能够介绍一下或者给点相关的资料，O(∩_∩)O谢谢
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1楼 2011-04-05 21:16:59
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gaoyang636

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
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看天(金币+4): 有理 2011-04-06 18:19:57
1 高通量不仅仅是焦磷酸测序；
2 罗氏的454是焦磷酸，但是通量比其他的二代低，每个RUN需要的银子也多，好处是读长很长（400bp+）；
3 Qiagen的焦磷酸测序还不是一般意义上的高通量二代测序，虽然测序原理是一样的，但是通量更小，且一般是需要自己选择目的基因并设计引物的；
4 LZ即便打算要做高通量了，也没必要自己去设计protocol，需要做的是选择适合自己的方案，然后会有现成的protocol，比你自己摸索的强……
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7楼2011-04-06 18:12:34
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janyan

银虫 (初入文坛)
★ ★ ★
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看天(金币+2): 鼓励交流 2011-04-06 12:57:50
那天QIAGEN公司的来讲了一次焦磷酸测序，有不少解决方案，而且貌似给他们做也省钱，你可以试试，我还没做过焦磷酸，只能提供这点信息咯，希望有用呵呵
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2楼2011-04-05 23:34:35
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JessieDai

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by janyan at 2011-04-05 23:34:35:
那天QIAGEN公司的来讲了一次焦磷酸测序，有不少解决方案，而且貌似给他们做也省钱，你可以试试，我还没做过焦磷酸，只能提供这点信息咯，希望有用呵呵

谢谢了哦，我也是听一个老师讲了一次而已，是要送给公司做，但是前面的PCR还是要自己做的，所以还要自己设计个试验方法。
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3楼2011-04-06 08:42:39
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家
★ ★ ★
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看天(金币+2): 鼓励回答 2011-04-06 12:58:03
嗯...对于不熟悉高通量测序，但又想做一些这方面实验的童鞋们，我的建议是先好好了解一下这项技术，想清楚实验目的是什么，测序要获得哪些主要信息。因为这个玩意儿少说也要几万块（小RNA之类不算），要测的样本多，几十万上百万的花费也是有可能的。所以先自己想明白了，才好和测序公司谈。
最后，更正一点，高通量测序可不止焦磷酸测序一种，具体的可以看看下面的资料~

http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=109434909uls2xeuwys00rq4
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4楼2011-04-06 09:29:53
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