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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助】启动子活性分析
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wangsibing1987

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】启动子活性分析 已有3人参与

最近想做一个基因的启动子活性分析，不知道该怎么分析，是不是截取ATG前面3K的地方？还是要包括第一外显子？
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1楼 2011-04-05 10:39:25
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65900931

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+1, EPI+1): good！ 2011-04-05 19:17:53
应该是TSS前2K到3K，以及TSS之后200到300.
不包括一些比较特殊的基因。
先查查文献，看看有没人研究过这个基因的启动子。
如果做转录因子，可以克隆到报告基因上做表达。
如果做chromatin remodeling那最好做内源的。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-04-05 13:15:56
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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)
★ ★
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amisking(金币+1): 鼓励发帖交流。 2011-04-05 19:17:42
那你要看你做什么，也可以选取从ATG后1-200bp，ATG前3K。
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2楼2011-04-05 12:41:10
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jhu132llh

荣誉版主 (知名作家)

大洪
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 65900931 at 2011-04-05 13:15:56:
应该是TSS前2K到3K，以及TSS之后200到300.
不包括一些比较特殊的基因。
先查查文献，看看有没人研究过这个基因的启动子。
如果做转录因子，可以克隆到报告基因上做表达。
如果做chromatin remodeling那最好做 ...

是的
最好先检索一下
看看还有没有在这个范围之外的增强子之类的
赞一下(1人) 回复此楼
青春的岁月，我们身不由己，只因这胸中燃烧的梦想！
4楼2011-04-05 16:51:37
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