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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 其他 » 【求助】如何显示晶胞结构中的原子编号与空间坐标？
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zyblhyzyx

银虫 (著名写手)

[交流] 【求助】如何显示晶胞结构中的原子编号与空间坐标？

用MS模拟了一个粉末的晶体结构，现想写出其晶胞结构中各原子的分数坐标，但不知如何导出文件。文件中要对应原子编号及分数坐标.
请高手出手相助，不胜感谢！
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1楼 2011-04-02 12:05:51
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)
★ ★
zyblhyzyx(金币+1):谢谢参与
sunyang1988(金币+1): 谢谢指点 2011-04-03 00:36:40
zyblhyzyx(金币+5): 谢谢帮助！ 2011-04-15 11:51:23
zyblhyzyx(金币+1): 2011-04-27 17:57:46
zyblhyzyx(金币+1): 2011-04-27 17:58:12
zyblhyzyx(金币+1): 2011-04-27 17:58:24
引用回帖:
Originally posted by zyblhyzyx at 2011-04-02 22:26:23:
好像只能标注原子名称呀！没有原子编号及原子坐标！

pdb文件试试
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5楼2011-04-02 23:41:58
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ioribest

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ellsaking(金币+1): 谢谢交流 2011-04-02 14:16:30
zyblhyzyx(金币+10): 谢谢帮助！ 2011-04-15 11:50:34
我也是初学者，我的笨办法就是存成cif格式，然后用vesta打开，里面直接copy出数据，然后倒到excel里面把需要的几列抽出来就可以了。
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2011-04-02 12:49:03
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dali2006

木虫 (著名写手)
★ ★
zyblhyzyx(金币+1):谢谢参与
sunyang1988(金币+1): 谢谢指点 2011-04-02 18:57:20
zyblhyzyx(金币+1): 谢谢帮助！ 2011-04-15 11:50:49
zyblhyzyx(金币+1): 2011-04-27 17:57:41
zyblhyzyx(金币+1): 2011-04-27 17:58:05
右键 有lable 功能，可以标注原子坐标及符号
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-04-02 18:55:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyblhyzyx

银虫 (著名写手)
★
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-04-02 22:44:07
引用回帖:
Originally posted by dali2006 at 2011-04-02 18:55:49:
右键 有lable 功能，可以标注原子坐标及符号

好像只能标注原子名称呀！没有原子编号及原子坐标！
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-04-02 22:26:23
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半熟的小苹果7楼
2011-04-03 08:45   回复  
zyblhyzyx(金币+1):谢谢参与
franch:编辑内容 2011-04-03 10:07
franch:编辑内容 2011-04-03 10:08
franch:编辑内容 2011-04-03 10:08
franch:编辑内容 2011-04-03 10:09
franch:编辑内容 2011-04-03 10:09
zyblhyzyx(金币+1): 2011-04-27 17:57:53
zyblhyzyx(金币+1): 2011-04-27 17:58:17
引用回帖:
Originally posted by zyblhyzyx at 2011-04-02 12:05:51: 用MS模拟了一个粉末的晶体结构，现想写出其晶胞结构中各原子的分数坐标，但不知如何导出文件。文件中要对应原子编号及分数坐标. 请高手出手相助，不胜感谢！

[ Last edited by franch on 2011-4-3 at 10:09 ]
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