| 查看: 1243 | 回复: 8 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】如何将pi-pi stacking 数据转换为cif内容 已有5人参与
|
|||
|
Cg•••Cg π stacking interaction Cg(I) Res(I) Cg(J) [ ARU(J)] Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S Alpha Beta Gamma CgI_Perp CgJ_Perp Slippage Cg(1) [ 1] -> Cg(1) [ 7556.01] 3.6867(10) -0.7507 0.5175 -0.4106 -7.6880 0.00 29.02 29.02 3.224 3.224 1.789 [ 7556] = 1/2-X,1/2-Y,1-Z 如上数据在cif文件中如何表述（table）？ 急需！！！！谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
中南大学易小艺课题组诚招2026申请-考核制博士生
已经有0人回复
-
海南师范大学招收化学博士（光电功能材料课题组招收博士研究生）
已经有10人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有90人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 有木有人用getcif.pl这个脚本把POSCAR转换为cif文件的
已经有4人回复
- ins.文件能否转换成cif文件 怎么转呢
已经有10人回复
- 求解：如何表征石墨烯、碳纳米管与苯环的pi-pi stacking？
已经有8人回复
- 下载的cif文件怎么转换成ins或res文件？？？？
已经有3人回复
- 【求助】pi-pi stacking DFT
已经有4人回复
- 【求助】帮忙 转换.cif 失败
已经有4人回复
- 【求助】pi-pi作用如何写入cif
已经有10人回复
- 【求助】如何将单晶衍射的相关数据转化为CIF格式？
已经有5人回复
- 根据晶体CIF资料转换Simulated XRD
已经有1人回复
- 【求助】Platon算出Pi-Pi堆积作用写入cif的格式
已经有5人回复
- 【请教】XRD数据如何转换为CIF格式
已经有5人回复
风采依旧135
新虫 (正式写手)
- 应助: 19 (小学生)
- 金币: 6721.9
- 散金: 122
- 红花: 2
- 帖子: 392
- 在线: 124.3小时
- 虫号: 480092
- 注册: 2007-12-15
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
7楼2011-04-15 22:45:29
xi2004
至尊木虫 (职业作家)
- CMEI: 10
- 应助: 125 (高中生)
- 金币: 16769.9
- 散金: 12393
- 红花: 221
- 帖子: 4161
- 在线: 436.9小时
- 虫号: 354550
- 注册: 2007-04-24
- 专业: 结构化学
3楼2011-03-28 07:58:43
stevenabing
至尊木虫 (正式写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 9913.7
- 散金: 1
- 红花: 8
- 帖子: 638
- 在线: 603.9小时
- 虫号: 63367
- 注册: 2005-04-09
- 专业: 天然药物化学
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
|
http://journals.iucr.org/services/cif/extratables.html Extra tables in CIF •hydrogen-bonding tables •extra tables •contacts tables Hydrogen-bonding tables The following data names should be used. loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_D _geom_hbond_site_symmetry_H _geom_hbond_site_symmetry_A _geom_hbond_publ_flag. Extra tables The following data names should be used. loop_ _publ_manuscript_incl_extra_item '_geom_extra_tableA_col_1' '_geom_extra_tableA_col_2' '_geom_extra_tableA_col_3' '_geom_extra_tableA_col_4' '_geom_extra_tableA_col_5' '_geom_extra_tableA_col_6' '_geom_extra_tableA_col_7' '_geom_extra_tableA_col_8' '_geom_extra_tableA_col_9' '_geom_extra_tableA_col_10' '_geom_extra_tableA_col_11' '_geom_extra_tableA_col_12' '_geom_extra_tableA_col_13' '_geom_extra_tableA_col_14' # up to 14 columns '_geom_extra_table_head_A' # for table heading '_geom_table_headnote_A' # for table headnote if needed '_geom_table_footnote_A' # for table fn if needed # and for a second extra table in the same datablock: '_geom_extra_tableB_col_1' '_geom_extra_tableB_col_2' '_geom_extra_tableB_col_3' '_geom_extra_tableB_col_4' '_geom_extra_tableB_col_5' '_geom_extra_tableB_col_6' '_geom_extra_tableB_col_7' '_geom_extra_tableB_col_8' '_geom_extra_tableB_col_9' '_geom_extra_tableB_col_10' # up to ten columns '_geom_extra_table_head_B' # for table heading '_geom_table_headnote_B' # for table headnote if needed '_geom_table_footnote_B' # for table fn if needed For example, adding the following lines to the CIF generates an exta table (Table 1), which is shown below as it would appear in the html version of the published paper. loop_ _publ_manuscript_incl_extra_item '_geom_extra_tableA_col_1' '_geom_extra_tableA_col_2' '_geom_extra_tableA_col_3' '_geom_extra_table_head_A' '_geom_table_footnote_A' loop_ _geom_extra_tableA_col_1 _geom_extra_tableA_col_2 _geom_extra_tableA_col_3 L 'Pd---P' 'Pd---Br' 'PTA^a^' 2.320(1) 2.427(1) 'PPh~2~(o-Cl-Ph)^b^' 2.350(2) 2.423(1) 'DDEP^c^' 2.325(3) 2.412(1) 'DPA^d^' 2.322(2) 2.447(1) 'ppq^e^' 2.318(1) 2.435(1) 'DMPP^f^' 2.319(2) 2.433(1) ? 2.313(2) 2.435(1) 'PPh~3~^g^' 2.34(4) 2.42(4) 'P(o-Tol)~3~^h^' 2.370(1) 2.445(2) _geom_extra_table_head_A ; Comparative geometrical parameters (\%A) for selected trans-[PdBr~2~(L)~2~] (L = tertiary phosphine ligand) complexes ; _geom_table_footnote_A ; Notes: (a) this work; (b) Coalter et al. (2000); (c) Ganguly et al. (1992) [DDEP is 2-(diphenylphosphino)ethanephosphonate]; (d) Podlahova et al. (1979) (DPA is diphenylphosphinoacetic acid); (e) Sembiring et al. (1995) (ppq is p-quinonyldiphenylphosphine); (f) Wilson et al. (1996) (DMPP is 1-phenyl-3,4-dimethylphosphole); (g) Stark et al. (1997); (h) Vicente et al. (1997). ; Table 1 Comparative geometrical parameters (Å  for selected trans-[PdBr2(L)2] (L = tertiary phosphine ligand) complexes L Pd-P Pd-Br PTAa 2.320 (1) 2.427 (1) PPh2(o-Cl-Ph)b 2.350 (2) 2.423 (1) DDEPc 2.325 (3) 2.412 (1) DPAd 2.322 (2) 2.447 (1) ppqe 2.318 (1) 2.435 (1) DMPPf 2.319 (2) 2.433 (1) 2.313 (2) 2.435 (1) PPh3g 2.34 (4) 2.42 (4) P(o-Tol)3h 2.370 (1) 2.445 (2) Notes: (a) this work; (b) Coalter et al. (2000); (c) Ganguly et al. (1992) [DDEP is 2-(diphenylphosphino)ethanephosphonate]; (d) Podlahova et al. (1979) (DPA is diphenylphosphinoacetic acid); (e) Sembiring et al. (1995) (ppq is p-quinonyldiphenylphosphine); (f) Wilson et al. (1996) (DMPP is 1-phenyl-3,4-dimethylphosphole); (g) Stark & Whitmore (1997); (h) Vicente et al. (1997). Contacts tables The following data names should be used. loop_ _publ_manuscript_incl_extra_item '_geom_contact_atom_site_label_1' '_geom_contact_atom_site_label_2' '_geom_contact_distance' '_geom_contact_site_symmetry_1' '_geom_contact_site_symmetry_2' '_geom_contact_publ_flag' loop_ _geom_contact_atom_site_label_1 _geom_contact_atom_site_label_2 _geom_contact_distance _geom_contact_site_symmetry_1 _geom_contact_site_symmetry_2 _geom_contact_publ_flag |
5楼2011-03-28 08:20:29
stevenabing
至尊木虫 (正式写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 9913.7
- 散金: 1
- 红花: 8
- 帖子: 638
- 在线: 603.9小时
- 虫号: 63367
- 注册: 2005-04-09
- 专业: 天然药物化学
8楼2011-04-16 07:19:32