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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】gromacs消除质心的运动
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zhulijuan001

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】gromacs消除质心的运动

gromacs可以用comm-mode，linear，angular等消除质心的平动和转动，我想问一下再模拟的过程中一定要消除质心的平动和转动吗？如果不消除会对模拟的结果有什么影响呢？
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1楼 2011-03-24 17:11:29
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nuaaxj

金虫 (小有名气)
★
zhulijuan001(金币+1): 谢谢参与
我也想知道啊
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2楼2018-03-19 20:59:40
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brucefan

专家顾问 (著名写手)
★
zhulijuan001(金币+1): 谢谢参与
一般初始化的时候整体的线动量和角动量都是归零的。由于计算精度的问题，后来可能不为零。一般用双精度都不会有什么问题。有时候模拟中引入了某些随机力，有可能会引起整体动量和角动量的改变，此时一般定期将它们归零。为什么要归零？难道你是希望模拟一个飞奔或者飞转的物体？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2018-03-19 23:45:58
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wdxmu3楼
2018-03-19 21:45   回复  
zhulijuan001(金币+1): 谢谢参与
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