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【求助】gromacs消除质心的运动
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zhulijuan001
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[交流]
【求助】gromacs消除质心的运动
gromacs可以用comm-mode,linear,angular等消除质心的平动和转动,我想问一下再模拟的过程中一定要消除质心的平动和转动吗?如果不消除会对模拟的结果有什么影响呢?
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2011-03-24 17:11:29
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nuaaxj
金虫
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★
zhulijuan001(金币+1): 谢谢参与
我也想知道啊
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2楼
2018-03-19 20:59:40
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brucefan
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★
zhulijuan001(金币+1): 谢谢参与
一般初始化的时候整体的线动量和角动量都是归零的。由于计算精度的问题,后来可能不为零。一般用双精度都不会有什么问题。有时候模拟中引入了某些随机力,有可能会引起整体动量和角动量的改变,此时一般定期将它们归零。为什么要归零?难道你是希望模拟一个飞奔或者飞转的物体?
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼
2018-03-19 23:45:58
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wdxmu
3楼
2018-03-19 21:45
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zhulijuan001(金币+1): 谢谢参与
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