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nancy-jj

金虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】在MS中如何定量描述所建分子的极性？偶极矩可以算吗？

在MS中如何定量描述所建分子的极性？分子的极性和偶极矩有关，偶极矩可以算吗？用哪个模块呢？大家帮忙~~先谢啦~~

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1楼 2011-03-22 11:28:36

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白玉浴血

木虫 (正式写手)

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引用回帖:

4楼: Originally posted by sushuo at 2011-03-31 14:36:49
采用QSAR模块可以大批量的计算分子的偶极距值，以及偶极距在x、y、z三个方向的分量。可以定量描述。“Total dipole” ，其中以Dmol3计算的最为准确。你可以从Help中搜索关键词“dipole”，可以找到相关的大量信息 ...

Charge partitioning by Hirshfeld method: ( 0.00333)
  C    1 charge                         -0.0281
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0362 -0.0117 -0.0103
  C    2 charge                         -0.0339
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0171 -0.0355 -0.0031
  C    3 charge                         -0.0295
      dipoles x,y,z  [au]             0.0316 -0.0128 0.0111
  C    4 charge                         0.0067
      dipoles x,y,z  [au]             0.0363 0.0037 0.0124
  C    5 charge                         -0.0288
      dipoles x,y,z  [au]             0.0161 0.0263 0.0030
  C    6 charge                         -0.0349
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0264 0.0274 -0.0119
  C    7 charge                         -0.0025
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0660 0.0318 -0.0206
  C    8 charge                         -0.0487
      dipoles x,y,z  [au]             0.0597 -0.0272 0.0199
  C    9 charge                         0.1793
      dipoles x,y,z  [au]             0.0234 -0.0675 0.0074
  O 10 charge                         -0.2840
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0478 -0.1334 -0.0156
  O 11 charge                         -0.1785
      dipoles x,y,z  [au]             0.0073 0.1601 0.0025
  H 12 charge                         0.0466
      dipoles x,y,z  [au]          -0.1358 -0.0352 -0.0423
  H 13 charge                         0.0461
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0427 -0.1402 -0.0022
  H 14 charge                         0.0438
      dipoles x,y,z  [au]             0.0787 -0.1120 0.0367
  H 15 charge                         0.0454
      dipoles x,y,z  [au]             0.0356 0.1409 0.0002
  H 16 charge                         0.0466
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0936 0.1061 -0.0398
  H 17 charge                         0.0449
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0009 0.1324 -0.0015
  H 18 charge                         0.0430
      dipoles x,y,z  [au]          -0.0080 -0.1427 -0.0033
  H 19 charge                         0.1708
      dipoles x,y,z  [au]             0.1860 0.0751 0我这是用Dmol得出来的，请问这个分子的偶极矩是不是最上面的0.00333