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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】如何计算该酶与每个配体的结合能？
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amo11000

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何计算该酶与每个配体的结合能？

有一个酶的晶体结构包含三个配体，如何计算该酶与每个配体的结合能？什么软件可以完成该操作？具体怎样操作？哪位牛人知道啊？万望赐教啊！在线等！


菜鸟敬上！
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1楼 2011-03-16 16:25:43
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zh1987hs

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by amo11000 at 2011-03-16 16:25:43:
有一个酶的晶体结构包含三个配体，如何计算该酶与每个配体的结合能？什么软件可以完成该操作？具体怎样操作？哪位牛人知道啊？万望赐教啊！在线等！


菜鸟敬上！

不会是什么2eiq啥的吧~呵呵~结合能简单的方法是用对接软件自带的打分函数，把单个配体从酶上剥离下来，再对接上去，看打分，AD就可以实现，复杂一点的方法用分子动力学模拟，AMBER就可以
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2楼2011-03-16 22:33:17
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