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金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何计算该酶与每个配体的结合能？

有一个酶的晶体结构包含三个配体，如何计算该酶与每个配体的结合能？什么软件可以完成该操作？具体怎样操作？哪位牛人知道啊？万望赐教啊！在线等！

菜鸟敬上！

1楼 2011-03-16 16:25:43

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金虫 (著名写手)

引用回帖:

Originally posted by amo11000 at 2011-03-16 16:25:43:
有一个酶的晶体结构包含三个配体，如何计算该酶与每个配体的结合能？什么软件可以完成该操作？具体怎样操作？哪位牛人知道啊？万望赐教啊！在线等！

菜鸟敬上！

不会是什么2eiq啥的吧~呵呵~结合能简单的方法是用对接软件自带的打分函数，把单个配体从酶上剥离下来，再对接上去，看打分，AD就可以实现，复杂一点的方法用分子动力学模拟，AMBER就可以

2楼2011-03-16 22:33:17

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