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amo11000

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助】如何计算该酶与每个配体的结合能?

有一个酶的晶体结构包含三个配体,如何计算该酶与每个配体的结合能?什么软件可以完成该操作?具体怎样操作?哪位牛人知道啊?万望赐教啊!在线等!


菜鸟敬上!
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Originally posted by amo11000 at 2011-03-16 16:25:43:
有一个酶的晶体结构包含三个配体,如何计算该酶与每个配体的结合能?什么软件可以完成该操作?具体怎样操作?哪位牛人知道啊?万望赐教啊!在线等!


菜鸟敬上!

不会是什么2eiq啥的吧~呵呵~结合能简单的方法是用对接软件自带的打分函数,把单个配体从酶上剥离下来,再对接上去,看打分,AD就可以实现,复杂一点的方法用分子动力学模拟,AMBER就可以
2楼2011-03-16 22:33:17
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