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voleyes

银虫 (正式写手)


[交流] 【求助】Amber中可不可以计算体系的绝对自由能?

不是结合自由能,而是绝对自由能

就像量子化学软件计算的自由能一样


例如要计算药物分子的绝对自由能随时间的变化,可不可以?
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manutdhk

木虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by voleyes at 2011-03-07 15:08:11:
不是结合自由能,而是绝对自由能

就像量子化学软件计算的自由能一样


例如要计算药物分子的绝对自由能随时间的变化,可不可以?

什么是绝对自由能?
自由能还能随时间变化的吗?
2楼2011-03-07 16:17:42
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voleyes

银虫 (正式写手)


例如整个蛋白质在溶剂中的自由能
截取轨迹上的点 来计算
就是随轨迹变化
3楼2011-03-08 13:43:30
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