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zhenfeili

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】没有pDOS 已有3人参与

在客户端做好文件后,拿到linux服务器上去算,原来选了pDOS,最后算完了分析时却出不来,有总spin DOS
问题在哪里?
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mazuju028

木虫 (正式写手)

★
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-03-06 22:38:09
分析时要选中原子
锐气藏于胸,和气浮于脸,才气见于事,义气施与人
2楼2011-03-06 16:25:28
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zhenfeili

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by mazuju028 at 2011-03-06 16:25:28:
分析时要选中原子

选了,
计算前存文件有三个  .cell文件
计算时只选了xx.cell, xx_bandstr.cell 和xx_dos.cell都没算
是不是不行呀?但是算完后total dos, total spin都有
3楼2011-03-08 08:46:49
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-03-08 10:11:33
引用回帖:
Originally posted by zhenfeili at 2011-03-08 08:46:49:
选了,
计算前存文件有三个  .cell文件
计算时只选了xx.cell, xx_bandstr.cell 和xx_dos.cell都没算
是不是不行呀?但是算完后total dos, total spin都有

似乎直接用cell文件计算的,pdos不知道怎么搞出来……因为CASTEP的重要数据都是在二进制文件中,想自行处理都不能……
但是如果是从客户端直接任务过去的,需要把计算后文件夹里的xsd文件打开,选择需要分析PDOS的原子,然后分析DOS,才能看到PDOS图。
思想重于技巧,内涵重于表象
4楼2011-03-08 09:17:44
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★
zzy870720z(金币+1): 谢谢补充 2011-03-08 10:11:43
引用回帖:
Originally posted by zhenfeili at 2011-03-08 08:46:49:
选了,
计算前存文件有三个  .cell文件
计算时只选了xx.cell, xx_bandstr.cell 和xx_dos.cell都没算
是不是不行呀?但是算完后total dos, total spin都有

顺便,xx.cell是用来进行自洽场计算的(包括弛豫),而xx_bandstr.cell是计算能带结构的,xx_dos.cell是计算态密度的,显然三个都要计算,并且后面两个需要第一个计算出来的临时数据
思想重于技巧,内涵重于表象
5楼2011-03-08 09:19:16
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zhenfeili

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by souledge at 2011-03-08 09:19:16:
顺便,xx.cell是用来进行自洽场计算的(包括弛豫),而xx_bandstr.cell是计算能带结构的,xx_dos.cell是计算态密度的,显然三个都要计算,并且后面两个需要第一个计算出来的临时数据

每次手动按步骤算吗?
算完xx.cell
再算xx_bandstr.cell
再算xx_dos.cell吗
6楼2011-03-08 09:59:50
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-03-09 20:32:17
引用回帖:
Originally posted by zhenfeili at 2011-03-08 09:59:50:
每次手动按步骤算吗?
算完xx.cell
再算xx_bandstr.cell
再算xx_dos.cell吗

没有,能带计算和态密度计算可能会需要到第一步自洽场计算的数据,所以一般是把这三个按照自洽、性能的顺序放在同一个任务中,也就是
$CASTEP_COMMAND xx.cell xx_bandstr.cell xx_dos.cell
的形式~
如果要算多个,可以这么写脚本:
$CASTEP_COMMAND xx.cell xx_bandstr.cell xx_dos.cell
$CASTEP_COMMAND yy.cell yy_bandstr.cell yy_dos.cell
$CASTEP_COMMAND zz.cell zz_bandstr.cell zz_dos.cell
思想重于技巧,内涵重于表象
7楼2011-03-09 17:47:12
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zhenfeili

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by souledge at 2011-03-09 17:47:12:
没有,能带计算和态密度计算可能会需要到第一步自洽场计算的数据,所以一般是把这三个按照自洽、性能的顺序放在同一个任务中,也就是
$CASTEP_COMMAND xx.cell xx_bandstr.cell xx_dos.cell
的形式~
如果要 ...

不明白脚本的意思
你是说
$CASTEP_COMMAND xx.cell xx_bandstr.cell xx_dos.cell
然后
./RunCASTEP.sh -np 8 xx.cell
吗?
8楼2011-03-09 21:51:04
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