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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】没有pDOS
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zhenfeili

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】没有pDOS已有3人参与

在客户端做好文件后，拿到linux服务器上去算，原来选了pDOS，最后算完了分析时却出不来，有总spin DOS
问题在哪里？
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1楼2011-03-06 09:59:57
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mazuju028

木虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-03-06 22:38:09
分析时要选中原子
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锐气藏于胸，和气浮于脸，才气见于事，义气施与人
2楼2011-03-06 16:25:28
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zhenfeili

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by mazuju028 at 2011-03-06 16:25:28:
分析时要选中原子

选了，
计算前存文件有三个  .cell文件
计算时只选了xx.cell, xx_bandstr.cell 和xx_dos.cell都没算
是不是不行呀？但是算完后total dos, total spin都有
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3楼2011-03-08 08:46:49
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-03-08 10:11:33
引用回帖:
Originally posted by zhenfeili at 2011-03-08 08:46:49:
选了，
计算前存文件有三个  .cell文件
计算时只选了xx.cell, xx_bandstr.cell 和xx_dos.cell都没算
是不是不行呀？但是算完后total dos, total spin都有

似乎直接用cell文件计算的，pdos不知道怎么搞出来……因为CASTEP的重要数据都是在二进制文件中，想自行处理都不能……
但是如果是从客户端直接任务过去的，需要把计算后文件夹里的xsd文件打开，选择需要分析PDOS的原子，然后分析DOS，才能看到PDOS图。
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思想重于技巧，内涵重于表象
4楼2011-03-08 09:17:44
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢补充 2011-03-08 10:11:43
引用回帖:
Originally posted by zhenfeili at 2011-03-08 08:46:49:
选了，
计算前存文件有三个  .cell文件
计算时只选了xx.cell, xx_bandstr.cell 和xx_dos.cell都没算
是不是不行呀？但是算完后total dos, total spin都有

顺便，xx.cell是用来进行自洽场计算的（包括弛豫），而xx_bandstr.cell是计算能带结构的，xx_dos.cell是计算态密度的，显然三个都要计算，并且后面两个需要第一个计算出来的临时数据
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思想重于技巧，内涵重于表象
5楼2011-03-08 09:19:16
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zhenfeili

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by souledge at 2011-03-08 09:19:16:
顺便，xx.cell是用来进行自洽场计算的（包括弛豫），而xx_bandstr.cell是计算能带结构的，xx_dos.cell是计算态密度的，显然三个都要计算，并且后面两个需要第一个计算出来的临时数据

每次手动按步骤算吗？
算完xx.cell
再算xx_bandstr.cell
再算xx_dos.cell吗
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6楼2011-03-08 09:59:50
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★
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zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-03-09 20:32:17
引用回帖:
Originally posted by zhenfeili at 2011-03-08 09:59:50:
每次手动按步骤算吗？
算完xx.cell
再算xx_bandstr.cell
再算xx_dos.cell吗

没有，能带计算和态密度计算可能会需要到第一步自洽场计算的数据，所以一般是把这三个按照自洽、性能的顺序放在同一个任务中，也就是
$CASTEP_COMMAND xx.cell xx_bandstr.cell xx_dos.cell
的形式～
如果要算多个，可以这么写脚本：
$CASTEP_COMMAND xx.cell xx_bandstr.cell xx_dos.cell
$CASTEP_COMMAND yy.cell yy_bandstr.cell yy_dos.cell
$CASTEP_COMMAND zz.cell zz_bandstr.cell zz_dos.cell
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思想重于技巧，内涵重于表象
7楼2011-03-09 17:47:12
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zhenfeili

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by souledge at 2011-03-09 17:47:12:
没有，能带计算和态密度计算可能会需要到第一步自洽场计算的数据，所以一般是把这三个按照自洽、性能的顺序放在同一个任务中，也就是
$CASTEP_COMMAND xx.cell xx_bandstr.cell xx_dos.cell
的形式～
如果要 ...

不明白脚本的意思
你是说
$CASTEP_COMMAND xx.cell xx_bandstr.cell xx_dos.cell
然后
./RunCASTEP.sh -np 8 xx.cell
吗？
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8楼2011-03-09 21:51:04
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