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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】高斯运行问题
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杨瑞09

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】高斯运行问题

user2@localhost yangrui]$ g03 dh4-f.com dh4-f.out&
[1] 14595
[user2@localhost yangrui]$ PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /tmp/user2/g03/Gau-14595.inp
In source file ml0.f, at line number 177
当输入运算时，就出现这个毛病，运行不下去！！
急急！！！
希望各位虫哟帮帮忙！！！
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1楼 2011-02-28 15:10:56
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杨瑞09

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by erylingjet at 2011-02-28 17:06:21:
呀，以前正常么？
高斯安装正常么？

上学期一直正常运行，这学期开学就不好使了，高斯安装正常呀
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3楼2011-02-28 19:28:49
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
杨瑞09(金币+5): 非常感谢 2011-03-01 19:44:11
引用回帖:
Originally posted by 杨瑞09 at 2011-02-28 19:28:49:
上学期一直正常运行，这学期开学就不好使了，高斯安装正常呀

检查一下你的环境变量中GAUSS_SCRDIR设置的是哪个目录？然后看看那个目录是否还在或者你是否有读写的权限？

cd $GAUSS_SCRDIR 这个命令可以达到上面所说的目的，如果提示没有此目录，那就自己新建一个 mkdir $GAUSS_SCRDIR
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4楼2011-02-28 20:06:23
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普通回帖

erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
呀，以前正常么？
高斯安装正常么？
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2楼2011-02-28 17:06:21
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abbott

金虫 (著名写手)
你如果把你的用户信息或者数据信息放在/tmp目录

你就等着出错吧....

系统reboot后, 会自动处理/tmp目录的东西的....
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5楼2011-03-01 14:27:32
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杨瑞09

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by abbott at 2011-03-01 14:27:32:
你如果把你的用户信息或者数据信息放在/tmp目录

你就等着出错吧....

系统reboot后, 会自动处理/tmp目录的东西的....

我没把用户信息放到tmp里呀，我是自己建的文件夹的，tmp里会存储一些计算产生的临时文件呀
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6楼2011-03-01 19:15:08
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杨瑞09

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by pwzhou at 2011-02-28 20:06:23:
检查一下你的环境变量中GAUSS_SCRDIR设置的是哪个目录？然后看看那个目录是否还在或者你是否有读写的权限？

cd $GAUSS_SCRDIR 这个命令可以达到上面所说的目的，如果提示没有此目录，那就自己新建一个 mkdir ...

您好，我查看了，没这个目录，但是也创建不了GAUSS_SCRDIR，这到底是怎么回事呢？谢谢帮忙。
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7楼2011-03-01 19:43:42
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 杨瑞09 at 2011-03-01 19:43:42:
您好，我查看了，没这个目录，但是也创建不了GAUSS_SCRDIR，这到底是怎么回事呢？谢谢帮忙。

在终端中输入：echo $GAUSS_SCRDIR看看是空的还是有路径
如果是空的，那么就说明你没设置这个变量，这样的话临时文件会写在和输入输出文件相同的目录下。如果你设置了这个变量，那么请保证你设置的这个目录是存在的并且你拥有读和写的权限。最简单的办法就是将这个目录设置为/tmp

比如，在.bashrc里面这样写：
export GAUSS_SCRDIR=/tmp
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8楼2011-03-01 21:08:31
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杨瑞09

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by pwzhou at 2011-03-01 21:08:31:
在终端中输入：echo $GAUSS_SCRDIR看看是空的还是有路径
如果是空的，那么就说明你没设置这个变量，这样的话临时文件会写在和输入输出文件相同的目录下。如果你设置了这个变量，那么请保证你设置的这个目录是 ...

您好！
     在终端echo ￥GAUSS_SCRDIR
出现/tmp/user2/g03
是不是就说明有这个变量。
运行产生的临时文件是不是要存在于/tmp中呀！再者，我怎么能看见这个目录我能不能看呢？非常感谢你的耐心赐教！
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9楼2011-03-02 16:57:40
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
杨瑞09(金币+5): 非常感谢！！ 2011-03-03 19:52:18
引用回帖:
Originally posted by 杨瑞09 at 2011-03-02 16:57:40:
您好！
     在终端echo ￥GAUSS_SCRDIR
出现/tmp/user2/g03
是不是就说明有这个变量。
运行产生的临时文件是不是要存在于/tmp中呀！再者，我怎么能看见这个目录我能不能看呢？非常感谢你的耐心赐教！

运行产生的临时文件可以保存在任何地方，这取决于你的$GAUSS_SCRDIR的设置，但是你必须保证你设置的这个目录是存在的，Gaussian不会自己去建立这个目录，所以你现在要做的就是 mkdir -p /tmp/user2/g03（然后你就能正常算了）
因为我相信/tmp/user2/g03这个目录在你的电脑上不存在的，很可能被你自己不小心给删了或者被系统管理员清理/tmp目录的时候把这个目录给删掉了。

[ Last edited by pwzhou on 2011-3-2 at 18:57 ]
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10楼2011-03-02 18:53:38
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杨瑞09

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by pwzhou at 2011-03-02 18:53:38:
运行产生的临时文件可以保存在任何地方，这取决于你的$GAUSS_SCRDIR的设置，但是你必须保证你设置的这个目录是存在的，Gaussian不会自己去建立这个目录，所以你现在要做的就是 mkdir -p /tmp/user2/g03（然后 ...

您好！
我按你说的建立目录，出现以下错误：
[user2@localhost ~] mkdir -p/tmp/user2/g03
mkdir: invalid option -- /
Try `mkdir --help' for more information.
这种情况改怎么解决呢！谢谢您！
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11楼2011-03-03 15:46:29
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 杨瑞09 at 2011-03-03 15:46:29:
您好！
我按你说的建立目录，出现以下错误：
[user2@localhost ~] mkdir -p/tmp/user2/g03
mkdir: invalid option -- /
Try `mkdir --help' for more information.
这种情况改怎么解决呢！谢谢您！

晕 -p和/tmp之间是有空格的
mkdir -p /tmp/user2/g03
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12楼2011-03-03 16:23:44
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zhanggao

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
165685楼: Originally posted by 杨瑞09 at 2011-03-03 15:46:29
您好！
我按你说的建立目录，出现以下错误：
mkdir -p/tmp/user2/g03
mkdir: invalid option -- /
Try `mkdir --help' for more information.
这种情况改怎么解决呢！谢谢您！...

可以吗》？我的貌似跟你同样的问题，建立文件夹貌似也是不行的。你的问题解决了吗？
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13楼2013-03-10 21:00:20
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zhanggao

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1375774楼: Originally posted by zhanggao at 2013-03-10 21:00:20
可以吗》？我的貌似跟你同样的问题，建立文件夹貌似也是不行的。你的问题解决了吗？...

我晕死，我的是GAUSS_SCRDIR=/home/xxx/g09_tmp.在 等号跟“/home”之间多i了个空格，
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14楼2013-03-10 21:08:27
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qyyos

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
也遇到这个问题了，折腾了一个多小时，发现，在root用户下，把存临时文件的文件夹权限改成777就好了
。
在我机器上，命令是    chmod 777 tmp
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15楼2015-01-27 10:50:10
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