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欣晴5832

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】有哪位知道系统发育研究中测定物种GC含量的意义呀?

如题,期待高手指教!
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cdl007

木虫 (正式写手)


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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+5, EPI+1): 很好很强大,继续发扬哦! 2011-05-26 22:06:29
Goodfellow 和 O'Donnell(1993) 提出 DNA 的 G+C mol% 差异≤ 10 % ~12 %及 16S rDNA 的序列同源性≥ 95 %的种可归为同一属。

每一个微生物种的 DNA 中 GC mol% 的数值是恒定的,不会随着环境条件、培养条件等的变化而变化,而且在同一个属不同种之间, DNA 中 GCmol% 的数值不会差异太大,可以某个数值为中心成簇分布,显示同属微生物种的 GC mol% 范围。 DNA 中 GC mol% 分析主要用于区分细菌的属和种,因为细菌 DNA 中 GC 含量的变化范围一般在 25 %~ 75 %;而放线菌 DNA 中的 GC 比例范围非常窄 (37 %~ 51%) 。一般认为任何两种微生物在 GC 含量上的差别超过了 10 %,这两种微生物就肯定不是同一个种。因此可利用 G+C mol %来鉴别各种微生物种属间的亲缘关系及其远近程度。值得注意的是,亲缘关系相近的菌,其 G+C mol %含量相同或者近似,但 G+C mol %相同或近似的细菌,其亲缘关系并不一定相似,这是因为这一数据还不能反映出碱基对的排列序列,而且如放线菌的 DNA 的 GC mol% 在 37 ~ 51 之间,企图在这么小的范围内区分放线菌的几十个属显然是不现实的。要比较两种细菌的 DNA 碱基对排列序列是否相同,以及相同的程度如何,就需做核酸杂交试验。

微生物如此,其他生物系统发育研究 也大抵如此
4楼2011-05-25 20:23:53
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zjx4700

木虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+5): Good! 2011-05-26 22:06:09
同一物种的gc含量应该差不多,不同物种gc含量差别很大,所以gc含量越大越不可能是一个种。
3楼2011-05-25 16:20:12
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珠珠虾米

新虫 (初入文坛)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
学习了,O(∩_∩)O~,最近我对这个也比较感兴趣。
5楼2011-05-26 16:47:41
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爱意浓浓

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
4楼: Originally posted by cdl007 at 2011-05-25 20:23:53
Goodfellow 和 O'Donnell(1993) 提出 DNA 的 G+C mol% 差异≤ 10 % ~12 %及 16S rDNA 的序列同源性≥ 95 %的种可归为同一属。

每一个微生物种的 DNA 中 GC mol% 的数值是恒定的,不会随着环境条件、培养条件 ...

厉害!

发自小木虫IOS客户端
6楼2017-12-24 15:19:37
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