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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)

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专业: 分离过程

[交流] 【讨论】计算两物质间稳定结构时出现虚频已有3人参与

在计算乙酸阴离子和乙炔分子的优化结构时产生了3个虚频，
刚接触量子化学，不太懂，要不要重新计算调整初始结构，
直到没有虚频产生呢？产生虚频就是说明这个稳定结构不是真实的么？
另外土问下，频率的数量是不是和体系的自由度是一样的，和原子个数
没有必然联系

下面是计算结果
****** 3 imaginary frequencies (negative Signs) ******
Diagonal vibrational polarizability:
   113.6709657    169.7497324    229.5308773
Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole), Raman scattering
activities (A**4/AMU), depolarization ratios for plane and unpolarized
incident light, reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A),
and normal coordinates:
                  1                   2                   3
                  A                   A                   A
Frequencies --  -145.4107             -53.3930             -28.9523
Red. masses --    6.4682                2.4268                1.4089
Frc consts  --    0.0806                0.0041                0.0007
IR Inten -- 12.5021                4.6504                4.9149
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6    0.00 0.00 0.03    0.00 0.00 0.05    0.00 0.00 0.01
2 8    0.00 0.00 0.01    0.00 0.00  -0.05    0.00 0.00 0.05
3 8    0.00 0.00 0.05    0.00 0.00 0.26    0.00 0.00 0.11
4 6    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00  -0.16    0.00 0.00  -0.11
5 1    0.00  -0.03  -0.02 -0.12  -0.42  -0.46    0.31 0.37 0.15
6 1    0.00 0.03  -0.02    0.12 0.42  -0.46 -0.31  -0.37 0.15
7 1    0.00 0.00 0.02    0.00 0.00 0.25    0.00 0.00  -0.67
8 1    0.00 0.00 0.13    0.00 0.00 0.02    0.00 0.00 0.02
9 6    0.00 0.00  -0.53    0.00 0.00  -0.02    0.00 0.00  -0.03
  10 6    0.00 0.00 0.46    0.00 0.00  -0.09    0.00 0.00  -0.05
  11 1    0.00 0.00  -0.69    0.00 0.00  -0.11    0.00 0.00  -0.09
                  4                   5                   6
                  A                   A                   A
Frequencies -- 31.9526             144.4258             172.5467
Red. masses --    6.2817                5.0237                4.0725
Frc consts  --    0.0038                0.0617                0.0714
IR Inten --    8.7633             13.2413                7.7934
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6    0.06 0.09 0.00    0.12 0.00 0.00 -0.06 0.05 0.00
2 8    0.35 0.06 0.00    0.10 0.00 0.00    0.00 0.05 0.00
3 8 -0.09 0.32 0.00    0.14  -0.03 0.00 -0.09 0.10 0.00
4 6 -0.11  -0.20 0.00    0.17 0.06 0.00 -0.13  -0.04 0.00
5 1 -0.25  -0.21 0.00    0.21 0.06 0.00 -0.18  -0.04 0.00
6 1 -0.26  -0.21 0.00    0.21 0.06 0.00 -0.18  -0.04 0.00
7 1    0.04  -0.39 0.00    0.13 0.11 0.00 -0.07  -0.11 0.00
8 1 -0.11 0.12 0.00 -0.32  -0.34 0.00    0.15  -0.49 0.00
9 6 -0.12  -0.05 0.00 -0.30  -0.24 0.00    0.15  -0.38 0.00
  10 6 -0.12  -0.25 0.00 -0.30 0.19 0.00    0.16 0.18 0.00
  11 1 -0.14  -0.43 0.00 -0.27 0.48 0.00    0.20 0.58 0.00
                  7                   8                   9
                  A                   A                   A
Frequencies -- 226.3358             460.0206             526.5706
Red. masses --    1.1261                3.2637                1.3207
Frc consts  --    0.0340                0.4069                0.2158
IR Inten -- 13.0345                6.9836             53.3997
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6    0.00 0.00 0.00    0.08 0.13 0.00    0.00 0.00 0.00
2 8    0.00 0.00 0.01 -0.14 0.16 0.00    0.01 0.00 0.00
3 8    0.00 0.00 0.03    0.23  -0.08 0.00    0.00 0.00 0.00
4 6    0.00 0.00 0.01 -0.10  -0.17 0.00    0.00 0.00 0.00
5 1    0.00 0.01 0.01 -0.43  -0.19  -0.01    0.00 0.01 0.00
6 1    0.00  -0.01 0.01 -0.43  -0.19 0.01    0.00 0.01 0.00
7 1    0.00 0.00 0.00    0.23  -0.58 0.00 -0.01 0.01 0.00
8 1    0.00 0.00  -0.49 -0.02  -0.02 0.00 -0.02  -0.23 0.00
9 6    0.00 0.00  -0.10 -0.02 0.01 0.00    0.00 0.08 0.00
  10 6    0.00 0.00 0.00 -0.02 0.00 0.00 -0.01  -0.15 0.00
  11 1    0.00 0.00 0.87 -0.02 0.00 0.00    0.09 0.95 0.00
                  10                   11                   12
                  A                   A                   A
Frequencies -- 595.6655             618.1063             851.1510
Red. masses --    2.8175                6.6813                1.0645
Frc consts  --    0.5890                1.5040                0.4544
IR Inten --    5.1937             20.0374             121.1658
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6    0.00 0.00 0.36    0.13  -0.07 0.00    0.00 0.00  -0.01
2 8    0.00 0.00  -0.11 -0.34  -0.06 0.00    0.00 0.00 0.00
3 8    0.00 0.00  -0.12 -0.08 0.33 0.00    0.00 0.00  -0.01
4 6    0.00 0.00 0.01    0.34  -0.23 0.00    0.00 0.00 0.00
5 1    0.52  -0.25  -0.19    0.35  -0.23 0.01 -0.03 0.02 0.01
6 1 -0.52 0.25  -0.19    0.35  -0.23  -0.01    0.03  -0.02 0.01
7 1    0.00 0.00  -0.33    0.35  -0.24 0.00    0.00 0.00 0.02
8 1    0.00 0.00 0.03    0.01 0.11 0.00    0.00 0.00 0.90
9 6    0.00 0.00  -0.01    0.00  -0.02 0.00    0.00 0.00  -0.06
  10 6    0.00 0.00  -0.01    0.00  -0.01 0.00    0.00 0.00  -0.04
  11 1    0.00 0.00 0.07    0.02 0.15 0.00    0.00 0.00 0.43
                  13                   14                   15
                  A                   A                   A
Frequencies -- 862.3403             926.1512             1059.9985
Red. masses --    5.8037                1.1197                1.4562
Frc consts  --    2.5428                0.5659                0.9640
IR Inten --    6.5203             78.1187             36.2170
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6 -0.21 0.13 0.00 -0.02 0.00 0.00    0.01 0.02 0.00
2 8    0.09 0.30 0.00    0.01 0.03 0.00    0.01  -0.06 0.00
3 8 -0.22  -0.21 0.00 -0.01  -0.04 0.00 -0.07  -0.02 0.00
4 6    0.28  -0.19 0.00    0.02  -0.01 0.00    0.10 0.13 0.00
5 1    0.34  -0.18 0.01    0.03  -0.01 0.00 -0.44 0.03  -0.05
6 1    0.34  -0.18  -0.01    0.03  -0.01 0.00 -0.44 0.03 0.05
7 1    0.28  -0.16 0.00    0.01  -0.01 0.00    0.58  -0.49 0.00
8 1 -0.03  -0.45 0.00    0.07 0.95 0.00    0.00 0.02 0.00
9 6    0.01 0.04 0.00 -0.01  -0.07 0.00    0.00 0.00 0.00
  10 6    0.01 0.01 0.00    0.00  -0.01 0.00    0.00 0.00 0.00
  11 1 -0.01  -0.16 0.00    0.03 0.28 0.00    0.00 0.00 0.00
                  16                   17                   18
                  A                   A                   A
Frequencies --  1072.2749             1299.8640             1416.5357
Red. masses --    1.6484             11.4102                1.2217
Frc consts  --    1.1167             11.3590                1.4444
IR Inten --    0.0197             293.1481             24.4852
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6    0.00 0.00 0.18    0.70  -0.32 0.00    0.01 0.00 0.00
2 8    0.00 0.00  -0.03 -0.05 0.32 0.00    0.00 0.00 0.00
3 8    0.00 0.00  -0.03 -0.34  -0.14 0.00    0.00 0.00 0.00
4 6    0.00 0.00  -0.15 -0.14 0.07 0.00 -0.12 0.08 0.00
5 1 -0.52 0.39 0.17 -0.14 0.08  -0.02    0.50  -0.19  -0.19
6 1    0.52  -0.39 0.17 -0.14 0.08 0.02    0.50  -0.19 0.19
7 1    0.00 0.00 0.23 -0.24 0.16 0.00    0.35  -0.48 0.00
8 1    0.00 0.00  -0.05    0.02  -0.05 0.00    0.00 0.00 0.00
9 6    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
  10 6    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
  11 1    0.00 0.00  -0.01 -0.01  -0.01 0.00    0.00 0.00 0.00
                  19                   20                   21
                  A                   A                   A
Frequencies --  1495.4422             1523.8030             1549.3715
Red. masses --    3.1614                1.0605                1.3491
Frc consts  --    4.1655                1.4508                1.9081
IR Inten -- 563.4290                4.9956             145.0666
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6    0.16 0.33 0.00    0.00 0.00 0.01 -0.06  -0.14 0.00
2 8 -0.02  -0.15 0.00    0.00 0.00 0.00    0.01 0.06 0.00
3 8 -0.10  -0.07 0.00    0.00 0.00 0.00    0.03 0.03 0.00
4 6 -0.05  -0.10 0.00    0.00 0.00 0.07 -0.03  -0.03 0.00
5 1    0.23 0.47 0.36 -0.42  -0.18  -0.08    0.09 0.50 0.37
6 1    0.23 0.47  -0.36    0.42 0.18  -0.08    0.09 0.50  -0.37
7 1    0.01  -0.09 0.00    0.00 0.00  -0.76    0.24  -0.34 0.00
8 1    0.05 0.03 0.00    0.00 0.00 0.00 -0.02  -0.01 0.00
9 6    0.01 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
  10 6 -0.01 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.01 0.00 0.00
  11 1 -0.02 0.01 0.00    0.00 0.00 0.00    0.01 0.00 0.00
                  22                   23                   24
                  A                   A                   A
Frequencies --  1851.4996             2984.2311             3035.2507
Red. masses --    3.6185                1.0324                1.1716
Frc consts  --    7.3084                5.4171                6.3592
IR Inten -- 117.0922             68.5828             900.3826
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6 -0.01  -0.02 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
2 8    0.00 0.01 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
3 8    0.01 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
4 6    0.00 0.00 0.00    0.03  -0.03 0.00    0.00 0.00 0.00
5 1    0.00 0.00 0.00    0.00 0.34  -0.50    0.00  -0.02 0.03
6 1    0.00 0.00 0.00    0.00 0.34 0.50    0.00  -0.02  -0.03
7 1    0.01  -0.01 0.00 -0.39  -0.33 0.00    0.00 0.00 0.00
8 1    0.68  -0.03 0.00    0.04 0.00 0.00    0.97  -0.08 0.00
9 6    0.34 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 -0.12 0.01 0.00
  10 6 -0.35 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.02 0.00 0.00
  11 1 -0.55 0.03 0.00    0.01 0.00 0.00    0.17  -0.01 0.00
                  25                   26                   27
                  A                   A                   A
Frequencies --  3066.9423             3088.6411             3434.0644
Red. masses --    1.0988                1.1015                1.1562
Frc consts  --    6.0898                6.1911                8.0338
IR Inten -- 44.9987             37.8182                0.1205
Atom AN    X    Y    Z       X    Y    Z       X    Y    Z
1 6    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
2 8    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
3 8    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00
4 6    0.00 0.00 0.09 -0.05  -0.08 0.00    0.00 0.00 0.00
5 1 -0.01 0.43  -0.56 -0.02 0.19  -0.30    0.00 0.00 0.00
6 1    0.01  -0.43  -0.56 -0.02 0.19 0.30    0.00 0.00 0.00
7 1    0.00 0.00 0.03    0.67 0.54 0.00    0.00 0.00 0.00
8 1    0.00 0.00 0.00    0.03 0.00 0.00    0.10  -0.01 0.00
9 6    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00 -0.04 0.00 0.00
  10 6    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00    0.11  -0.01 0.00
  11 1    0.00 0.00 0.00    0.00 0.00 0.00 -0.98 0.10 0.00

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1楼 2011-02-23 10:49:31

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引用回帖:

Originally posted by lingznpmg at 2011-02-24 10:30:14:
如果确定是稳定点,把虚频消掉就可以啦,先消最大的那个,小的虚频可能也会消失!

怎么消掉虚频啊，不太懂，能说具体点么

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4楼2011-02-25 16:23:50

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kerro

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改变一下初始结构再算

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2楼2011-02-24 01:52:39

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lingznpmg

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如果确定是稳定点,把虚频消掉就可以啦,先消最大的那个,小的虚频可能也会消失!

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3楼2011-02-24 10:30:14

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1
                  A
Frequencies --  -145.4107
Red. masses --    6.4682
Frc consts  --    0.0806
IR Inten -- 12.5021
Atom AN    X    Y    Z
1 6    0.00 0.00 0.03
2 8    0.00 0.00 0.01
3 8    0.00 0.00 0.05
4 6    0.00 0.00 0.00
5 1    0.00  -0.03  -0.02
6 1    0.00 0.03  -0.02
7 1    0.00 0.00 0.02
8 1    0.00 0.00 0.13
9 6    0.00 0.00  -0.53
  10 6    0.00 0.00 0.46
  11 1    0.00 0.00  -0.69
这个频率下面的坐标是分子相对于你优化坐标的偏离值(振动,用Gview看),你把这些坐标数值直接(或者乘0.2或0.5等)加到优化后的分子坐标上,再进行优化,可能会消掉虚频.

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5楼2011-02-25 20:20:02

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小白如水

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