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cxydujuan

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助】求助cif中的两个A类错误。急!

A类错误:
PLAT036_ALERT_1_A No s.u. Given for Flack Parameter ..............          ?
PLAT368_ALERT_2_A Short  C(sp2)-C(sp2) Bond  C17    -   C18    ...       0.94 Ang.
怎么解决啊?请教高手!非常紧急
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cxydujuan(金币+10): 2011-02-22 09:07:44

1.不知你精修时有没有用到twin命令,如果仅仅用了一个twin(即TWIN  1 0 0  0 -1 0  0 0 -1),那么就会出现没有s.u.的情况。
你可以在精修时使用这样的一对命令:
TWIN  1 0 0  0 -1 0  0 0 -1
BASF  0.5
Flack参数就给出偏差值s.u.。

2.C=C双键距离太短,一般在1.32-1.38之间。限制一下键长试试,可使用命令:
dfix  1.32  0.01  C17  C18
3楼2011-02-21 21:00:35
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★ ★
帝夫(金币+2): 感谢您的回复! 2011-02-21 21:01:39
cxydujuan(金币+5): 2011-02-22 09:07:38
引用回帖:
Originally posted by cxydujuan at 2011-02-21 12:14:09:
A类错误:
PLAT036_ALERT_1_A No s.u. Given for Flack Parameter ..............          ?
PLAT368_ALERT_2_A Short  C(sp2)-C(sp2) Bond  C17    -   C18    ...       0.94 Ang.
怎么解决啊?请教高手!非 ...

第一个错误:
1. 如果有手性且有重原子,那在修正中加入Flack指令,修正后重新产生CIF。
2. 如果没有手性,或有手性但用Mo靶做小于Si元素的结构,则可在CIF的原子信息这一栏的最后面添加一句话,如下所示:
_chemical_melting_point                ?
_chemical_absolute_configuration       ' unk '
2楼2011-02-21 20:53:24
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cxydujuan

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 帝夫 at 2011-02-21 13:00:35:
1.不知你精修时有没有用到twin命令,如果仅仅用了一个twin(即TWIN  1 0 0  0 -1 0  0 0 -1),那么就会出现没有s.u.的情况。
你可以在精修时使用这样的一对命令:
TWIN  1 0 0  0 -1 0  0 0 -1
BASF  0.5
F ...

精修之后又出现了以下错误:
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   8.821
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       8.82

请问该如何处理呢?麻烦了
4楼2011-02-22 10:41:59
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引用回帖:
Originally posted by cxydujuan at 2011-02-22 02:41:59:
精修之后又出现了以下错误:
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   8.821
           ...

您可以加大精修轮数,20或25~~
5楼2011-02-22 15:05:41
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