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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 有关于几种做代谢网络的软件
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bettyshan

木虫 (正式写手)

[交流] 有关于几种做代谢网络的软件

小虫是学生物的，最近想做一点有关于代谢网络重构，及菌种的in silico design.
看到有很多算法，用得比较好的有OptGene，OptKnock, MOMA等~~
因为对计算机程序还是比较陌生，不知道哪位有了解这些算法和软件的，如果实现其计算模拟呢？

非常感谢大家啦，欢迎交流~
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1楼 2011-02-20 16:40:42
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babyzhaohui

新虫 (初入文坛)
建议试试COBRA
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2楼2011-10-08 10:08:04
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jieke0633

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
其实这些算法的实用性存在概率问题，特别是optKnock
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3楼2013-04-10 18:03:59
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dingshaozhen

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by jieke0633 at 2013-04-10 18:03:59
其实这些算法的实用性存在概率问题，特别是optKnock

你用optknock么？看文献原理不是很清楚，大侠能讲一下么？小虫不胜感激~
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4楼2015-12-20 14:49:18
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