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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】关于ms5.5的问题
汕头大学海洋科学接受调剂
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ll921

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于ms5.5的问题

我的ms 运行CASTEP 时候running 一段后会出现失败信息，而DMol 可以正常运行呢？
高手帮帮忙
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1楼 2011-01-21 20:56:07
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)
★
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-01-22 09:55:50
ll921(金币+5): 2011-03-02 08:49:08
希望能吧错误信息贴出来，大家讨论下
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2楼2011-01-22 00:29:32
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jluzzw

铁杆木虫 (正式写手)
★
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-01-22 09:56:06
请问LZ用MS5.5算Dmol时是否Convergence和Energies文件都显示出来了？ 我运算的时候发现只出现Convergence并且其为空白图，不知道是否人也遇到过这种现象。
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3楼2011-01-22 08:24:57
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ll921

木虫 (正式写手)
这个错误信息 有的时候还不出来
什么也没改啊




[ Last edited by ll921 on 2011-1-22 at 09:28 ]
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4楼2011-01-22 08:53:32
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ll921

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by jluzzw at 2011-01-22 08:24:57:
请问LZ用MS5.5算Dmol时是否Convergence和Energies文件都显示出来了？ 我运算的时候发现只出现Convergence并且其为空白图，不知道是否人也遇到过这种现象。

我还没有研究到 这些东西，刚刚接触 不好意思啊
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5楼2011-01-22 08:54:36
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)
★ ★
sunyang1988(金币+2): 谢谢交流 2011-01-22 13:07:23
引用回帖:
Originally posted by ll921 at 2011-01-22 08:53:32:
这个错误信息 有的时候还不出来
什么也没改啊




[ Last edited by ll921 on 2011-1-22 at 09:28 ]

yes看一下结果
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6楼2011-01-22 10:30:26
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gongjijun

木虫 (正式写手)
★
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-01-22 13:07:31
要看后缀为castep的文件中的最后的信息。
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7楼2011-01-22 10:39:06
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ll921

木虫 (正式写手)
Error: ion_set_Q_at_origin_recip: error opening page file
Current trace stack:
ion_set_Q_at_origin_recip
ion_int_Q_at_origin_recip
nlpot_calculate_d
electronic_prepare_H
electronic_minimisation
check_elec_ground_state
castep
OMP: Warning #2: Cannot open message catalog "2052\libiomp5ui.dll":
OMP: System error #126: 找不到指定的模块。
OMP: Info #3: Default messages will b

是看这些东西吗？
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8楼2011-01-22 11:26:55
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ll921

木虫 (正式写手)
This version was compiled for i686-windows-msvc2008 on Sep 22 2010

License checkout of MS_castep successful


Pseudo atomic calculation performed for O 2s2 2p4

Converged in 23 iterations to a total energy of -429.2136 eV


Pseudo atomic calculation performed for Ti 3s2 3p6 3d2 4s2

Converged in 32 iterations to a total energy of -1596.0329 eV


Pseudo atomic calculation performed for Zn 3d10 4s2

Converged in 43 iterations to a total energy of -1707.8834 eV

Calculation parallelised over    1 nodes.
K-points are distributed over    1 groups, each containing    1 nodes.

************************************ Title ************************************
CASTEP calculation from Materials Studio

***************************** General Parameters ******************************
  
output verbosity                               : normal  (1)
write checkpoint data to                       : Zn2TiO4.check
type of calculation                            : single point energy
stress calculation                             : off
density difference calculation                 : off
electron localisation func (ELF) calculation   : off
Hirshfeld analysis                             : on
unlimited duration calculation
timing information                             : on
memory usage estimate                          : on
write final potential to formatted file        : off
write final density to formatted file          : off
  
output         length unit                     : A
output           mass unit                     : amu
output           time unit                     : ps
output         charge unit                     : e
output         energy unit                     : eV
output          force unit                     : eV/A
output       velocity unit                     : A/ps
output       pressure unit                     : GPa
output     inv_length unit                     : 1/A
output      frequency unit                     : cm-1
output force constant unit                     : eV/A**2
output         volume unit                     : A**3
output   IR intensity unit                     : (D/A)**2/amu
output         dipole unit                     : D
output         efield unit                     : eV/A/e
output        entropy unit                     : J/mol/K
  
wavefunctions paging                           : none
random number generator seed                   : randomised (112354824)
data distribution                              : optimal for this architecture
optimization strategy                          : balance speed and memory

*********************** Exchange-Correlation Parameters ***********************
  
using functional                               : Perdew Burke Ernzerhof
Divergence correction                          : off
DFT+D: Semi-empirical dispersion correction    : off

************************* Pseudopotential Parameters **************************
  
pseudopotential representation                 : reciprocal space
representation                      : reciprocal space

**************************** Basis Set Parameters *****************************
  
plane wave basis set cut-off                   :   300.0000   eV
size of standard grid                          :     1.5000
largest prime factor in FFT                    :          5
finite basis set correction                    : none

**************************** Electronic Parameters ****************************
  
number of  electrons                           :  480.0   
net charge of system                           :  0.000   
net spin   of system                           :  0.000   
number of  up  spins                           :  240.0   
number of down spins                           :  240.0   
treating system as non-spin-polarized
number of bands                                :        289

********************* Electronic Minimization Parameters **********************
  
Method: Treating system as metallic with density mixing treatment of electrons,
         and number of  SD  steps               :          1
         and number of  CG  steps               :          4
  
total energy / atom convergence tol.           : 0.2000E-05   eV
eigen-energy convergence tolerance             : 0.3875E-06   eV
max force / atom convergence tol.              : ignored
convergence tolerance window                   :          3   cycles
max. number of SCF cycles                      :        100
number of fixed-spin iterations                :         10
smearing scheme                                : Gaussian
smearing width                                 : 0.1000       eV
Fermi energy convergence tolerance             : 0.3875E-07   eV

************************** Density Mixing Parameters **************************
  
density-mixing scheme                          : Pulay
max. length of mixing history                  :         20
charge density mixing amplitude                : 0.5000   
cut-off energy for mixing                      :  300.0       eV
charge density mixing g-vector                 :  1.500       1/A

*********************** Population Analysis Parameters ************************
  
Population analysis with cutoff                :  3.000       A

*******************************************************************************
  

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
   8.4608000   0.0000000   0.0000000        0.7426231   0.0000000   0.0000000
   0.0000000   8.4608000   0.0000000        0.0000000   0.7426231   0.0000000
   0.0000000   0.0000000   8.4608000        0.0000000   0.0000000   0.7426231

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =    8.460800          alpha =   90.000000
                    b =    8.460800          beta  =   90.000000
                    c =    8.460800          gamma =   90.000000

                       Current cell volume =  605.667524       A**3

                           -------------------------------
                                     Cell Contents
                           -------------------------------
                         Total number of ions in cell =   56
                      Total number of species in cell =    3
                        Max number of any one species =   32

            
                         No user defined ionic velocities

                           -------------------------------
                                   Details of Species
                           -------------------------------

                               Mass of species in AMU
                                    O   15.9989996
                                    Ti   47.9000015
                                    Zn   65.3799973

                          Electric Quadrupole Moment (Barn)
                                    O   -0.0255800 Isotope 17
                                    Ti    0.3020000 Isotope 47
                                    Zn    0.1500000 Isotope 67

                          Files used for pseudopotentials:
                                    O O_00PBE.usp
                                    Ti Ti_00PBE.usp
                                    Zn Zn_00PBE.usp

                           -------------------------------
                              k-Points For BZ Sampling
                           -------------------------------
                       MP grid size for SCF calculation is  2  2  2
                         Number of kpoints used =           4

             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
             +  Number       Fractional coordinates        Weight  +
             +-----------------------------------------------------+
             +     1   0.250000   0.250000   0.250000   0.2500000  +
             +     2   0.250000   0.250000  -0.250000   0.2500000  +
             +     3   0.250000  -0.250000   0.250000   0.2500000  +
             +     4   0.250000  -0.250000  -0.250000   0.2500000  +
             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

                           -------------------------------
                               Symmetry and Constraints
                           -------------------------------

         There are no symmetry operations specified or generated for this cell
         There are no ionic constraints specified or generated for this cell
                      Maximum deviation from symmetry =  0.00000         ANG
               Point group of crystal =     1: C1, 1, 1

                        Centre of mass is NOT constrained

                         Number of cell constraints= 0
                         Cell constraints are:  1 2 3 4 5 6

                         External pressure/stress (GPa)
                          0.00000   0.00000   0.00000
                                    0.00000   0.00000
                                              0.00000
  
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                                     Memory          Disk    |
| Model and support data                              255.3 MB       138.5 MB |
| Electronic energy minimisation requirements         225.9 MB       126.0 MB |
|                                               ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node             481.2 MB       264.5 MB |
|                                                                             |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates |
+-----------------------------------------------------------------------------+
Error: ion_set_Q_at_origin_recip: error opening page file
Current trace stack:
ion_set_Q_at_origin_recip
ion_int_Q_at_origin_recip
nlpot_calculate_d
electronic_prepare_H
electronic_minimisation
check_elec_ground_state
castep
OMP: Warning #2: Cannot open message catalog "2052\libiomp5ui.dll":
OMP: System error #126: 找不到指定的模块。
OMP: Info #3: Default messages will b
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9楼2011-01-22 11:28:26
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lbambool

木虫 (著名写手)
★
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-01-22 14:10:56
ll921(金币+5): 2011-03-02 08:48:18
找一个系统自带的结构试一下看是你的结构的问题还是软件的问题，还是设置的问题，一样一样的排除
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10楼2011-01-22 14:09:10
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ll921

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by lbambool at 2011-01-22 14:09:10:
找一个系统自带的结构试一下看是你的结构的问题还是软件的问题，还是设置的问题，一样一样的排除

如果是结构的问题 DMo也可以正常使用吗？l
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11楼2011-01-22 16:13:45
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gongjijun

木虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢交流 2011-01-22 16:54:52
看看需要的赝势文件有没有？
另，同意楼上观点。
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12楼2011-01-22 16:18:41
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niliu

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教，不太明白这个值怎么回事？ 2011-01-22 16:55:24
你是win7系统吧！

右键单击计算机，选择属性->高级->环境变量，新建一个系统变量KMP_WARNINGS，值设为0
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13楼2011-01-22 16:40:37
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ll921

木虫 (正式写手)
赝势 的文件是什么样子的？
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15楼2011-01-23 16:12:34
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nan1026feng

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，在吗？请问你的问题解决了吗？我也出现了这个问题，很着急啊
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16楼2013-01-12 21:12:38
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nan1026feng

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，你这个问题我现在已经解决了，是管理权限的问题，把权限更改后就一切正常了
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17楼2013-01-14 10:49:25
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zyxme14楼
2011-01-22 18:09   回复  
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