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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】对MSD编程中周期性边界的不解
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astringent

铜虫 (著名写手)

[交流] 【求助】对MSD编程中周期性边界的不解

最近在看MSD ，但是对周期性边界条件理解不上去。我在看Computer simulation of liquids时，对于计算MSD，说上有这样一段：it is important not to switch attention
from one periodic image to another, which is why it is sometimes useful to have
available a set of particle coordinates which have not been subjected to
periodic boundary corrections during the simulation 。
但是当我看相关程序的时候，去使用了周期性边界条件 ，我一直没想明白，请大家帮忙分析一下？
            dowhile (dx .gt. xbox2)
               dx = dx - xbox
            end do
            dowhile (dx .lt. -xbox2)
               dx = dx + xbox
            end do
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1楼 2011-01-18 06:27:33
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