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jj2006

木虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】新手关于gaussian运行求助！（急！急！急！悬赏求解！）

本人菜鸟，刚开始学习gaussian，经过一个星期摸索，终于安装成功软件linux RedHat版.
但是输入测试文档后，输出文件最后只到这一步（如下面所示）：
Rotational constants (GHZ): 919.0227225 408.0852053 282.5991530
Standard basis: STO-3G (5D, 7F)
There are    4 symmetry adapted basis functions of A1  symmetry.
There are    0 symmetry adapted basis functions of A2  symmetry.
There are    1 symmetry adapted basis functions of B1  symmetry.
There are    2 symmetry adapted basis functions of B2  symmetry.
Integral buffers will be 131072 words long.
Raffenetti 1 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
   7 basis functions, 21 primitive gaussians,    7 cartesian basis functions
   5 alpha electrons       5 beta electrons
   nuclear repulsion energy       9.1571759100 Hartrees.
NAtoms= 3 NActive= 3 NUniq= 2 SFac= 1.69D+00 NAtFMM= 80 NAOKFM=F Big=F
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis=    7 RedAO= T  NBF=    4    0    1    2
NBsUse=    7 1.00D-06 NBFU=    4    0    1    2
这个结果与给出的标准输出明显不同（似乎没有计算完毕）。
我又依次输入了top——u——usr命令检测系统进程，并没有发现有相关gaussian程序执行，换了不同输入文档（来自小木虫，正确性因该不会有问题），重复了很多次，结果依然，均没有在最后的log看到任务结束的显示。
我想知道到底是程序本身没有安装好？还是我的操作不当结束了程序？或者gaussian程序依然在执行，只是我没有看到？怎样才知道gaussian是否安装成功？如何知道执行程序是否依然进行?希望大家给予指点，不胜感激！

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1楼 2011-01-15 16:28:18

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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

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jj2006(金币+10): 多谢指教 2011-01-17 19:35:55

首先，建议任何新手包括高手在内，输入文件的命令行都要写成#p ******的形式，也就是#后面一定要紧跟一个字母p，这样输出文件内容会更丰富，便于跟踪系统运行到哪里，对出错信息的描述更加丰富；
其次，递交命令应该是g09 yourfile.gjf&，然后回车，也就是文件结尾跟上一个&符号，表示放到后台运行；
然后用top命令看301,502等等是否跑起来了；
如果递交任务后需要退出，一定要用exit命令来退出，不要直接关闭ssh的窗口，否则随着你的退出，任务可能就同时被终止了。如果这个账号有多人登录运行，也许别人的误操作也会kill掉你的进程。
由于没有#p的命令，从你的输出文件中看不到任何错误信息。。。
再试一次，把错误信息贴出来，大家看看。