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ZJboy

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】奇怪的分子轨道图 已有9人参与

各位有没有试过用GV读取formchk文件作分子轨道图时,有时得到一些很奇怪的图的现象?如果有的话,不妨讨论一下。还是说,各位总是能得到合理的分子轨道图?

[ Last edited by zhou2009 on 2011-1-15 at 09:10 ]
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zhou2009(金币+3): 2011-02-02 10:55:20
从LCAO-MO角度来讲 没有任何MO是怪异的 任何MO都能直接归结到AO和组合系数上 有些人发现某些轨道非常“怪异” 往往因为这个轨道十分弥散或者过于高层
11楼2011-01-30 10:57:05
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zhou2009(金币+3): 2011-02-02 10:56:28
引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2011-01-30 21:03:50:

就像下图这样???



反键大弥散空轨道而已 很正常 不奇怪
不要采用Gaussian默认的cube,自己定义cube就能查看完整图
你这个图 由于cube太小 某些球球被截掉了
14楼2011-01-31 09:54:06
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zhou2009(金币+3): 2011-02-02 10:58:42
引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2011-01-31 09:58:02:
Thank you.
看起来画出来的分子轨道是分子轨道轮廓图或者叫分子轨道界面图,是吧?

这个……究竟叫什么图呢 其实我也不知道 我一直叫他“分子轨道等值面图” 你看你的GaussView里生成MO图像的时候,是不是有个isovalue呀?我一般采用0.02(默认值)看起来你也是.管他叫什么图呢 我在论文里从来不写“这个叫做什么图”,而是“从Figure1中看,这个MO如何如何”
引用回帖:
不过从这个图看起来,是不是氢原子对LUMO贡献很大?

看起来是很大 应该是氢原子的外层空AO为主要组成成分。但是谁知道,你要计算pop=full咱们才知道。有些时候单纯通过外形来判断是有可能出错的
看形状 这个轨道应该是以氢原子的外层空AO为主要组成成分的。嗯……你再算个pop=full确认下
18楼2011-01-31 10:08:13
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zhou2009(金币+3): 2011-02-02 10:59:25
引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2011-01-31 10:29:41:

已计算,下面为输入命令:
%mem=200MW
%chk=bim-anion1-sp1.chk
#p b3lyp/6-311++g** iop(6/7=3) scf=tight pop=(full,nbo) density=current  gfprint

sp1 of bim-H

-1 1
C                  0.0000 ...

你为什么要写nbo? 而且iop(6/7=3)与pop=full同义,你为什么要计算density你觉得把基组信息用gfprint显示出来很有意思是吧,嫌你的输出文件不够大是吧唉,而且scf(tight)有必要么,既然只是为了得到population而已,我汗,这都是谁教你的……你嫌自己计算时间不够长还是咋的……汗死
你直接用#t b3lyp 6-311++g** pop=full不就行了……

一小时后补充:而且 如果你原先的chk文件还保留的话 直接用#t b3lyp/chkbasis pop=full guess=read geom=allcheck会更加节省时间。如果这样做的话,就不要再输入分子说明部分了,因为分子结构、电荷、多重度均会从原先的chk中读取。这样做最大的好处是:基组、密度拟合基、分子结构、电荷和多重度都不必重新设定和计算了,对于你的计算来说,可谓飞速

[ Last edited by yjcmwgk on 2011-2-1 at 11:26 ]
21楼2011-02-01 09:59:47
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引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2011-02-01 20:56:04:

不只想得到布居,还希望得到尽可能准确的能量。

那随便你咯 呵呵
23楼2011-02-02 16:52:13
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引用回帖:
Originally posted by ggdh at 2011-02-05 23:41:13:
如果给的图是LUMO的话,那么肯定算错了。
因为这个分子的lumo肯定是Pi轨道
[ Last edited by ggdh on 2011-2-5 at 23:46 ]

额?作者有说过这是LUMO吗?大概是我看帖不仔细啦,呵呵

to 作者:这肯定不是LUMO,一定是很高层的轨道
29楼2011-02-09 16:12:24
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Originally posted by ZJboy at 2011-01-31 11:24:53:
请问过于高层会导致什么结果?谢谢。

庞大的弥散呗
30楼2011-02-09 16:14:22
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